肯尼迪(John F. Kennedy)就任美国总统后,在美国对印尼的外交政策方面进行了较大调整:一是,在印尼推行民事行动项目(Civic Action Program),该项目在苏加诺政府可接受的范围内,符合肯尼迪对第三世界推行的战略框架,也符合美国政府有意扶持印尼陆军的一贯思维;二是,出面协调解决了印尼与荷兰之间的西伊里安(West Irian)问题,找到了印尼、荷兰和美国三方都能接受的解决方案,对于印尼来讲,西伊里安主权重回印尼令苏加诺政府感到满意;三是,肯尼迪在幕僚的建议下,倾向于与苏加诺建立较为良好的私人关系。肯尼迪政府的相关政策使印尼与美国之间的关系较艾森豪威尔政府时期有了一定程度的缓和,但肯尼迪政府之所以缓和与印尼的关系,其根本动因在于压制印尼共力量的发展壮大、阻止印尼共夺权,维护美国在印尼和东南亚的战略利益,在这点上肯尼迪政府与艾森豪威尔政府并无本质区别,只是策略不同而已。