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地理大发现带来的全球性商贸活动，使得商业经营方式发生了影响至今的转变，促进了现代经济管理模式的诞生。在合伙制进一步推广的同时，出现了特权公司、特许公司、股份公司等新兴经济组织形式，现代经济的发展从此开始了新纪元。
新兴的欧洲国家为了获取直接的利益，采取了出卖特权给私人企业的方式，代理行和特许公司随之发展起来。特许公司一类是契约公司，另一类是早期的股份公司，出现于16至17世纪的荷兰和英国，是其在对外扩张中采用的最重要的商业组织形式，即政府用特权交换利益的典型形式。其中，股份公司又以东印度公司、西印度公司为典型代表。
更微观层面的商业技巧也有创新。由于金银货币融通的数额巨大、转手频繁、距离遥远，钱币业开始从商品流通中独立出来，成为日后金融业的先驱。复式记账法、“记账与划账”的结算制度也在逐渐成形，使债权和债务相互抵充，在任何时点和时段上都可以体现收支状况和资本结余，风险头寸也同时表现出来，这就确定了股份公司的动态价值。今天常见的汇票、用以分摊风险的委托制和合伙制的雏形，乃至保险业也在初露端倪。如果没有地理大发现所提供的契机，这场商业制度革命很难说要在何时才能真正到来。