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对纤维肌痛综合征的认知，西方医学界经历了四百余年的漫长过程。对本病的描述最早可追溯到1592年，当时被称为肌肉风湿症（muscular rheumatism）。此后，随着对疾病认识的深入，1904年William Gowers在《英国医学杂志》发表文章时首次使用了“纤维组织炎”（fibrositis）一词。同年病理学家Ralph Stockman首次对这种慢性疼痛进行了描述：“疼痛，有僵直感，肌肉活动受限，易感到疲劳，缺乏精力和活力。”他认为，肌肉疼痛患者的肌束间质中有炎性病灶，认为本病是由“纤维组织炎症”引起。1938年美国P.S.Hench教授将个别病例定性为原发性或继发性纤维组织炎，其子P.K.Hench教授对此概念进行了阐释。当时的观点是，本病在没有相关的潜在疾病时被认为是原发性的，而在有潜在风湿性疾病或其他器质性疾病时应被认为是继发性的。此后的70年间，西方医学界未能在组织病理找到充分的证据以支持“纤维组织炎症”是这一种炎症性疾病。因此，1976年美国P.K.Hench教授认为，这些临床表现是相互关联的变化同时出现的一系列症候群，故提出本病的新病名——纤维肌痛综合征。随后，在1977年，关于本病压痛点的临床试验开始开展。1987年美国风湿病学会将本病划为一种独立的疾病，1990年发布了包含特定部位压痛点的第一版分类标准。在1989年，Hudson 和Pope教授提出了本病的医学功能症候群和一些精神疾病（包括抑郁症、恐慌症、暴食症和强迫症）都通过“情感谱系障碍”机制相互关联。1991年，世界卫生组织将纤维肌痛确认为一种真正的疾病，并接受了美国风湿病学会的诊断标准。1999年，Bennett根据已发表的文章，发表了一篇综述论文，提出中枢敏化（CS）是纤维肌痛综合征发病的依据。
由于1990年的诊断方法主要针对FMS的疼痛/压痛区域，忽略了其他重要的临床领域，为了纠正这一不足，2010年制定了一套新的标准，其中包含有广泛疼痛指数（WPI，范围为0～19）和躯体严重程度量表（SSS，范围为0～12）。2011年对2010年方案进行修订，由患者完成问卷，并由临床医生进行审阅。方案的作者强调，其目标是促进流行病学研究和消除医生的一些采访负担。为更好地区分纤维肌痛综合征与局部疼痛综合征，2016年，美国风湿病协会再次发布纤维肌痛综合征的修订诊断标准，并指出纤维肌痛综合征的诊断与其他疾病的诊断无关，并不排斥其他临床重要疾病的存在。
纤维肌痛患者心理和生理上的痛苦已引起医学界的关注，关于纤维肌痛综合征的流行病学报道、临床治疗和发病机制、疗效机制研究日渐增多。