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中國醫學，可分數期：自西周以前，爲萌芽之期，春秋戰國爲成熟之期，兩漢之世爲專門傳授之期，魏晉至唐爲蒐葺殘缺之期，兩宋至明爲新説代興之期，起自明末，盛於有清，爲主張復古之期；此一切學術皆然，而醫學亦莫能外也。
諸學之中，儒學最顯，今試借以爲喻。仲尼祖述堯舜，憲章文武，《詩》、《書》、《禮》、《樂》、《易》、《春秋》，皆西周以前古籍，孔子因之，以成删定之功。六經皆史之説，雖亦不免武斷，要非前無所承決矣，所謂西周以前爲萌芽之期也。及孔子出而集其大成，七十子後學之徒，傳播其説遂臻極盛，所謂春秋戰國爲成熟之期也。遭秦焚書，六籍殘闕，然老師宿儒，猶各抱專門，以相授受。其時承學之士守家法皆極嚴，雖復不能相通，而亦不爲臆論，所謂兩漢之世，爲專家授受之期也。漢末喪亂，傳緒載絶，後之學者，不復能親承口説，而徒求之於簡編，於是有南北朝隋唐義疏之學，所謂蒐葺闕佚之期也。至於宋儒，乃排棄舊説，以意推求，自謂淵源直接洙泗，元明二代，其説大行，所謂新説代興之期也。明末諸儒厭其末流之空疏，而復求之於古，至於清代，漢學乃代宋學而興，所謂主張復古之期也。中國治漢宋二學者，每互相訾謷，其於自漢迄唐諸儒，遂各以意爲好惡。平心論之，中國一切學術，規模皆大定於戰國以前，自秦以降，不過就古人之成説，引伸推衍之耳，未有能自創一説，卓然與古人並立者也。近之論者，謂中國學術，自秦以降，即停滯不進，誠不爲過。夫既已不能自創一學，而徒襲古人之學以爲學矣，則其於古人之成説，焉得不視同拱璧？漢唐諸儒之抱殘守闕，自不能謂爲無功，然其物既已殘闕矣，徒能抱之守之，而不復能觀其會通，勢必至於扞格而不可通，齟齬而不相入，宋儒之起而以意推求勢也。然學術之真，必存於事物，古人之發明學術者，蓋靡不即事物而求其所以然，其在宋儒，雖亦曰即物窮理，實則徒託空言而不免仍爲古人之成説所囿，其必不能盡當於事物之理之真，且必不能盡得古人立説之意，蓋可知也。清儒之起而主張復古亦勢也，勢之所必至，即爲理之所固然。《易》曰：“窮則變，變則通。”相變也而實相因，亦即所以相成。明於進化之理者，固不必更存主奴之見矣。
惟醫亦然。吾國醫學之興，遐哉尚矣。《曲禮》：醫不三世，不服其藥。孔《疏》引舊説云：三世者：一曰黄帝鍼灸，二曰神農本草，三曰素女脈訣，又云，夫子脈訣。此蓋中國醫學最古之派别也。其書之傳於後世者，若《靈樞經》，則黄帝鍼灸一派也，若《本經》，則神農本草一派也，若《難經》，則素女脈訣一派也；其筆之於書，蓋亦在周秦之際，皆專門學者所爲也。鍼灸之有黄帝，本草之有神農，脈訣之有素女，猶之仲尼所祖述之堯舜，憲章之文武也；其筆之於書之人，則祖述憲章之仲尼也；其傳承派别可以推見者，華元化爲黄帝鍼灸一派， 華佗，字元化，漢末沛國譙人。 張仲景爲神農本草一派， 張機，字仲景，東漢南陽人。 秦越人爲素女脈訣一派。 秦越人，即扁鵲，戰國時齊國勃海鄚人。 仲景之師，元化之弟子，皆著見載籍。《史記·扁鵲列傳》載其所治諸人，多非同時，或疑史公好奇，不衷於實，不知“扁鵲”二字，乃治此派醫學者之通稱也，秦越人則其中之一人耳；此其專家授受，各有師承，猶兩漢之有經師也，特醫學之顯，不及儒術，故其傳授世次，不可得而考耳；其中絶不知何時，然亦必當漢魏之際，故後此治醫學者，若皇甫士安， 皇甫謐，字士安，晉安定朝那人。 若陶弘景， 陶弘景，字通明，南朝丹陽秣陵人。 皆無復口説可承，而徒求之於簡編也。其蒐討掇拾之功最巨者，於隋則有巢元方， 巢元方，隋大業中太醫博士。 於唐則有孫思邈、 孫思邈，唐華原人。 王燾。 王燾，唐郿人。 此醫家義疏之學也。 南北朝隋唐諸儒，綴輯漢儒之説，孫、王等蓋亦綴輯漢後醫家所傳也。 北宋以後，新説漸興， 《四庫提要》云：儒家之門户分於宋，醫家之門户分於金元，此以其顯著者言也，實則其機亦肇自北宋，見後。 至金、元而大盛，張、劉、朱、李之各創一説，競排古方，猶儒家之有程、朱、陸、王，異於漢而又自相歧也。至明末而復古之風漸啓，清代醫家多承之，則猶儒家之有漢學矣。 均見後。 人不能無爲時勢所限，而時勢之遷變，又率由一二人造之，還相爲因，莫知其朕，欲明於學術之升降者，知人論世，二者固不容闕一矣。