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灵长总目 包括啮齿动物和灵长动物。啮齿动物有啮齿目的松鼠、河狸、豪猪、豚鼠和鼠，以及兔形目的兔子。灵长动物有树鼩目的树鼩、皮翼目的鼯猴，以及灵长目的各种猿猴。人类属于灵长目。
灵长目 包括卷鼻亚目和简鼻亚目。卷鼻亚目有狐猴总科和懒猴总科。简鼻亚目有眼镜猴总科、新世界猴总科、旧世界猴总科和人猿总科。人类属于人猿总科。
人猿总科 包括两个科，长臂猿科和人科。人类和猩猩都属于人科。
人科 过去分为猩猩科和人科，猩猩（红猩猩）、大猩猩和黑猩猩三个属归为猩猩科，人类归为人科，但是这种分类缺乏生物学的依据。由于黑猩猩等类人猿与现代人的基因组差异极小，人类与黑猩猩属的遗传距离远小于大猩猩与猩猩的遗传距离，最终猩猩科与人科合并了。根据遗传谱系，人科可以分为猩猩亚科和人亚科，红猩猩属于猩猩亚科，大猩猩、黑猩猩和人类都属于人亚科。人亚科又分为金刚族和人族，大猩猩属于金刚族，而黑猩猩和人类属于人族。所以，我们人类来自猩猩。
人族 源于大约700万年前，早期有图迈人属、千禧人属、发展出黑猩猩属的地猿属，以及发展出傍人属和平脸人属的南猿属。真人属在200多万年前源于平脸人属，是普通意义上的人类。
真人属 该属中，前期演化出树居人、能人、卢道夫人、匠人等物种和亚种，后期从匠人演化出170多万年前的直立人和120多万年前的智人两大物种。各个人类物种之间是有生殖隔离的，即杂交后无法产生有生育能力的后代。
智人物种 该物种演化出多个亚种，包括先驱人、海德堡人，以及由海德堡人分化出的非洲罗得西亚人、西方尼安德特人和东方丹尼索瓦人，最后演化出现代人这一亚种。基于对现代人、尼安德特人、丹尼索瓦人的基因组分析比较，发现他们是在80万~60万年前分化的，所以，属于智人的海德堡人分化以后形成的亚种可以相应分为南方智人、北方智人和东方智人三支。各个亚种之间有生殖障碍，较难产生有效后代。
现代人亚种 属于南方智人，起源于非洲的罗得西亚人，大约20万年前发生了体质变化，在约7万年前走出非洲，扩散到全世界，形成现今的8个地理种，也就是种族。
地理种 相互之间没有生殖隔离，只有因漫长的旧石器时代的地理隔离并适应不同的地域环境而形成了不同的体质特征。8个地理种包括东非草原的布须曼种、中非雨林的俾格米种、西非草原的尼格罗种、环地中海的高加索种、东南亚雨林的尼格利陀种、远东沿海的澳大利亚种、东亚的蒙古利亚种和美洲的亚美利加种。Y染色体的谱系演化与种族的形成是在旧石器时代同步发生的，因此两者有较好的对应关系。
民族类群 这是农业起源以后人群向农业核心聚合的产物。人类从一万多年前开始发明农业，7000年前开始孕育文明，在不同的地区形成文明中心，并演化成考古文化区系。这些区系之间有了文化隔离，所以不同区系的人群既有文化差异也有遗传差异和语言差异，并孕育成今天的民族类群和语系。东亚蒙古利亚种的语系有南亚（孟高棉）、苗瑶、南岛、侗傣、汉藏、阿尔泰（满蒙-突厥-日韩）、叶尼塞（匈羯）、古亚、乌拉尔这9个。语系族群与Y染色体类群和基因组结构有着很好的对应关系。
家族 这是与Y染色体对应关系最明确的人群单位。中国人以家谱追思先祖、铭记血缘关系。同一个家谱中记录的是相同姓氏的家族成员。姓氏多继承自父亲，而Y染色体是严格的父子相传的基因组片段。所以有共同姓氏的男性可能有相同或相近的Y染色体类型。因此，Y染色体可用以研究很多姓氏宗族的历史，甚至千百年前的历史疑案，比如曹操的身世之谜。