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综上所述，武器装备体系的效能评估研究已经取得了较大的进展，对武器装备体系包括武器装备的设计选型、效费分析、作战运用、优化配置等各个方面发挥了重要作用，但是仍然存在以下一些问题：
1.效能数据处理
用于武器装备体系效能分析的原始数据相当分散，很难收集，处理起来也相对困难。这也是提高武器装备系统作战效能评估可靠性的一大障碍。
2.效能评估模型
目前武器装备系统效能评估方法基本上都属于静态分析，并且主要基于装备系统，不能实时地反映体系效能的动态变化过程，特别是基于作战任务过程的效能评估模型目前还与武器装备在真实对抗条件下效能的真实效果有一定误差。
3.针对性和作战环境
武器装备系统作战效能分析方法的针对性和环境适应性均需加强，主要表现在效能指标不能完整地体现武器装备系统作战效能与作战任务及作战环境间的量化关系。
4.新数学理论
传统的研究不确定性仅用概率统计的方法来描述显然是不完善的。模糊数学理论的引入，是近年来武器装备效能评估方法发展的趋势。灰色系统认为事物的不确定性不仅是随机性、不清晰性，还有一些关键信息的缺乏。现代武器装备系统的性能日益提高，使得影响其效能的因素繁多，概率统计方法要求数据越多越好，以便建立统计规律。灰色理论的引入，是近年来武器装备系统效能评估方法发展的又一趋势。
5.智能科学发展
随着智能控制科学的快速发展，各种智能控制理论如雨后春笋般涌现出来，如模糊控制、神经网络、遗传算法等新的智能控制方法应用于武器装备系统作战效能评估中，提高了作战效能的可靠性。
6.信息化发展需求
从国内外武器装备系统作战效能的发展来看，为适应未来信息化战争复杂多变的需求，提高整体作战效能，应朝着信息化的方向发展。因此结合实时信息化作战要求，武器装备系统的作战效能评估方法也将是发展大趋势。
7.多学科信息融合技术
多学科设计优化（Multidisciplinary Design Optimization，MDO）作为一种新的工程学科和设计思想，已经得到了多个行业的认同，但在武器装备效能评估分析领域的应用起步较晚。当前武器装备系统作战效能评估方法的研究成果较多，但是优化的研究成果较少，导致最优武器装备系统效能评估方法有待进一步提升。