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即使希望在孩子的大脑中建立虚拟阶梯，但对于整合，我们的期待要立足于现实，有两个重要的原因。下层大脑在孩子出生时就已经十分发达，而上层大脑要到一个人二十几岁时才能够完全发育成熟。事实上这是大脑最后发育的一个部分。在孩子几岁的时候，上层大脑一直在大规模施工，然后在十几岁到成年初期，还要经历一次大规模的改建。
想象一下，房子的一楼已施工完成，设施齐全，但是抬头看二楼，你可以看到它仍未完工，到处散落着建筑工具。透过未完成的房顶你甚至可以看到一片片天空，这就是你的孩子的上层大脑——还在进行中的工程。
这些信息对父母来说非常重要，因为这意味着所有在以上清单中列出的能力，这些我们希望孩子掌握的行为和技能，比如明智的决策、控制身体和情绪、共情、自我理解和道德，都依赖于那部分还没有发育完全的大脑。因为上层大脑仍在“施工”当中，它不能在任何时候都发挥全部的功能。也就是说，它不能和下层大脑整合，也不能一直以最佳状态工作。因此，孩子很容易被困在下层。没有上层大脑的作用，孩子很容易大发雷霆，做出荒谬的决定，而且普遍缺乏共情和自我理解能力。
这就是孩子不能很好地同时运用上层大脑和下层大脑的第一个原因：他们的上层大脑还未发育成熟。另外一个重要原因与下层大脑的一个特定部位有关，这就是杏仁核。