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主要依据水生花卉的造景功能、形态特征以及生态习性进行分类，分为挺水型植物、浮叶型植物、漂浮型植物、沉水型植物、岸边湿地植物和滨海湿地植物6大类。
（1）挺水型植物
根或地下茎扎入泥中生长发育，上部植株挺出水面；一般植株高大，花色鲜艳，大多有茎和叶的分化；大型的如芦苇、千屈菜、荷花、菖蒲和慈姑等，小型的如杉叶藻、西洋菜和水芹等。
（2）浮叶型植物
根或地下茎扎入泥中生长发育，无地上茎或地上茎柔软不能直立，叶漂浮于水面；一般根状茎发达，花大型，色彩丰富而鲜艳；大型的如睡莲、王莲、芡实等，小型的有莼菜、水鳖和荇菜等。
（3）漂浮型植物
根不扎入泥土，植株漂浮于水面，位置不定，随风浪和水流四处漂浮；植株中等大小，或小型；通常以观叶为主，如满江红、大漂，少数观花，如水葫芦等。
（4）沉水型植物
根或地下茎扎入泥中生长发育，上部植株沉于水中；一般花小型，以观叶为主，如苦草、黑藻、海菜花等。
（5）岸边湿地植物
适宜在淡水水体岸边生长的植物，类型多样，草本、乔木和灌木均有。该类植物具有适应陆地和水体环境的双重习性。
（6）滨海湿地植物
适宜在海岸生长的植物，以红树林植物为主，同时适应海岸潮湿环境的其他植物也属此类。
在自然界和造园实践中有时上述分类的界线不是截然分明的，比如挺水植物和岸边湿地植物、漂浮植物与浮叶植物。部分湿地植物可以生长在浅水中，表现了挺水植物的功能，如许多蓼属植物常作为湿地植物应用，但可以生长在水体中做挺水植物。部分漂浮型的水生植物，如水葫芦，可以在浅水区扎根于土壤成为浮叶植物或岸边湿地植物，同时形态上有所改变，其具漂浮功能的、海绵状膨大的叶柄退化。浮叶型的菱属植物有时可以漂浮在水面成为漂浮型植物。