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FLOTRAN单元的一些局限性：
●在同一次分析中不能改变求解的区域。
●单元不支持自由流面边界条件。
●ANSYS程序的某些特征不能同FLOTRAN单元一起使用。
●使用FLOTRAN单元时不能使用某些命令或菜单。
●当使用ANSYS的图形用户界面时，程序将只能显示那些在菜单和对话框中的FLOTRAN SetUp部分要求的特征和选项。
当使用FLOTRAN单元时，要避免使用ANSYS的某些特征和命令，要注意到在使用FLOTRAN单元时与别的分析稍微有些不同，当使用了无效的命令时，程序会给出相应的警告或错误信息。使用FLOTRAN单元要注意如下几点（下面所列命令相应的菜单路径请参见ANSYS命令手册或联机帮助中的“Commands and Their Location in the GUI”）：
●FLOTRAN单元不能和其他单元联合使用。
●节点坐标系必须与总体坐标系一致。
●CLEAR命令并不破坏已存在的FLOTRAN结果文件（Jobname.RFL），这有助于防止用户不小心破坏那些花了很多时间和精力才求得的结果，必须在操作系统里才能删除那些无用的结果文件。
●CP命令通过对自由度进行耦合来形成周期边界条件，ANSYS命令手册对CP 命令的描述是可以只对某些自由度进行耦合，但作FLOTRAN分析时，周期边界的所有自由度都将被耦合。
用户不能对同一个单元中的节点进行耦合，相邻单元间节点耦合也很困难。
●ADAPT命令不适用于FLOTRAN分析。
●不能用ANTYPE命令引入FLOTRAN的瞬态分析。
●FLOTRAN分析不支持自动时间步长功能，详见“FLOTRAN瞬态分析”。
●如果通过BFCUM、BFDELE或BFUNIF来定义节点热源，则ANSYS会在内部用BFE命令来代替。
●不能使用“LDREAD，FORC”命令使电磁载荷转换到FLOTRAN分析中，必须使用相应的宏来进行转换。
●FLOTRAN分析不能使用CE、CECMOD、CEDELE和DEINTF命令。
●FLOTRAN分析不能使用CNVTOL命令设置收敛容差。
●不能用DSYM命令定义FLOTRAN的对称和反对称边界条件。
●FLOTRAN不支持旋转坐标系中的角加速度矢量。
●在FLOTRAN分析中，使用“FLDATA4，TIME”命令而不是DELTIM命令来定义一个载荷步的时间。
●对于FLOTRAN分析，不能使用DESOL命令或PRESOL命令修改节点的热（HEAT）、流（FLOW）或流密（FLUX）结果。
●FLOTRAN分析不允许将积分点结果外推到节点上（ERESX命令）。
●FLOTRAN分析不允许通过镜像操作来形成单元。
●FLOTRAN分析不能用KBC命令施加渐变载荷，必须用多个载荷步逐渐改变载荷。
●FLOTRAN分析不允许用LCCALC、LCDEF、LCFA、LCFI等命令做不同载荷状况之间的运算操作。
●NCNV命令中的收敛工具不能用于FLOTRAN中相互独立的求解器。
●FLOTRAN分析不允许用NEQUIT命令定义非线性分析的平衡迭代数。
●FLOTRAN分析要求节点坐标系必须是总体笛卡儿坐标系，故不能用N命令、NMODIF命令和NROTAT命令的旋转域。
●FLOTRAN分析中，“FLDATA2，ITER”命令和“FLDATA4，TIME”命令用来控制一个载荷步中的总体迭代数。
●FLOTRAN分析不允许用户自定义单元。
●FLOTRAN分析中，“FLDATA2，ITER”命令和“FLDATA4，TIME”命令用来对写入数据库中的结果进行控制。
●PRNLD命令不能用于FLOTRAN分析中，因为其不能将边界条件作为可打印的单元节点载荷来保存。
●FLOTRAN分析中没有节点反力解。
●部分和预定义求解选项（PSOLVE命令定义）不适用于FLOTRAN各自独立的求解器。
●TIME命令不能用在FLOTRAN分析中。
●FLOTRAN用“FLDATA1，SOLU”命令而不是TIMINT命令定义瞬态载荷步。
●FLOTRAN用“FLDATA4，TIME”命令而非TRNOPT命令定义瞬态分析选项。