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《医经解惑论》是由日本汉方医家内藤希哲（1701—1735）所著，成书于1731年。全书约14万字，分上、中、下三卷。
作者少时学医专攻《伤寒论》，上溯《内》《难》，反复研读，颇通大义。遂感慨魏晋以降，为医者渐失经旨、学仲景者亦不能尽其道、为医不深究仲景著作，则天下汗牛充栋之医书，皆能迷惑。作者认为仲景书支离缺裂，前后错乱，彼此杂糅，后世不得其主体而明其本旨。因而奋然用功，以修仲景之道为事，将《伤寒论》《金匮要略》《玉函经》三书合参，分类条次，正其错杂，著成《金匮玉函经类编》。
《金匮玉函经类编》草创于1726年，仅编有《太阳篇》三卷、《阳明篇》一卷及《坏病篇》二卷，但念及此书篇幅浩繁而写作精力有限，加之生活条件所迫而无资付梓，作者出于无奈与不甘，遂又解往日之疑惑，漫书概括重编《金匮玉函经类编》全部之大意，凝练为《医经解惑论》三卷。之后《金匮玉函经类编》一直处于搁笔状态，直至内藤希哲去世30年后由其门生小岛瑞依照《医经解惑论》与希哲生前草稿私淑其教，朝研夕究，略得其肯綮，继而续编注解成书，名之曰《伤寒杂病论类编》。
《医经解惑论》的核心思想不外乎作者的“五经一贯论”与“六经括百病，以法类方证”。内藤希哲认为“夫医之有五经也，犹儒之有六经也。儒而不通于六经，不可以为儒矣；医而不通于五经，岂可以为医哉！故凡为医者，不可不熟读之、精思之，而得其一贯之本旨也”，《伤寒杂病论》“之于四经，犹《论语》之于六经”“诚四经之总括也”“万病虽多，而感于外者，不过六气；伤于内者，不过饮食劳倦七情；而至其为病，则不过于在表里上下而为虚实寒热也”，仲景之书“正欲穷万病之本源，极万病之变态，尽脉证治法之枢机”。为此他研究整理的方法是以六经为纲，六病为纬，辨病、治病之法为目，以法类方证，重新编次。《医经解惑论》上卷主论五经医理，中卷论伤寒六经大意，下卷专论六经病治法。如此归类，层次清晰，简明扼要，作者核心之旨昭彰易见。
纵观《医经解惑论》全书，实为现存研究内藤希哲学术思想体系罕有的重要法本，也是内藤希哲生前唯一的个人系统著述。如果把后人为其整理的《伤寒杂病论类编》看作是研究各论，那么《医经解惑论》可以看作是内藤希哲学术思想体系的总论。作者于书中立意深远，思想深刻，其中透露出的许多真知灼见又足以另读者为之拍案惊奇，与后世国内许多著名医家的经典立论不谋而合，可见其医学建树之高、思想纬度之广。
此次校注于国内尚属首次，对于内藤希哲的学术思想在国内的普及与传承具有十分重要而又特殊的意义。同时为了加深读者对于《医经解惑论》的理解，我们以选评的形式在原文中做了些许补充与强调，从而更好地帮助读者在研读此书的过程中提炼要点、深入重点。佛家禅宗有云：“千年暗室，一灯即明。”但愿此书的点校与出版能为中医界增添一份新的生机与希望，也能让国内中医人得以洞窥内藤希哲中医学术思想之魅力。