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导致儿童肥胖的因素众多，一般分为遗传因素、环境因素及行为因素。
肥胖是多基因相互作用的结果，目前确定的负责调控体重的主要基因位于2、10、11和20号染色体上。这些肥胖相关基因会通过调整代谢及内分泌水平，增加儿童的脂肪堆积。
父母肥胖对孩子的体重有至关重要的影响。有研究发现，与正常体重父母的孩子相比，父母一方肥胖的孩子发生肥胖的风险要高3.25倍（母亲肥胖）和1.54倍（父亲肥胖）；如果父母双方均肥胖，则孩子的肥胖风险增加10.44倍。可见父母的BMI越大，其后代发生肥胖的概率越高。
除了遗传孩子肥胖基因，父母还会把那些不良的生活习惯“遗传”给孩子，而后者的致胖影响比前者还要大。
母亲体内脂肪含量过高，分泌的炎症因子就会增加。母体的促炎状态会影响胎儿的早期发育及营养供给。有研究表明，在妊娠早期及中期（孕7月之前）的营养不良会增加儿童肥胖的风险，而妊娠后期的营养过剩也与儿童肥胖有关。因为妊娠后期胎儿脂肪细胞数量及体积均迅速增加，营养过度给予会进一步增加脂肪的数量及体积，为儿童肥胖奠定“牢固”的基础。
妊娠期血糖的升高会改变胎儿在宫内的生存环境，刺激胎盘过度增长，导致胎盘运输的营养物质增加甚至过度，更容易生产巨大儿（婴儿出生时体重超过8斤）。这样的孩子不但儿童期容易肥胖，而且成年后肥胖、三高的发生率也比正常人高5～20倍；同时，低出生体重儿（婴儿出生时体重小于5斤）的“追赶式生长”也容易引起后天的肥胖。
除了这些因素，在动物实验中还发现尼古丁可以使小鼠体重及脂肪含量增加。早期生命理论提示，母亲吸烟会增加孩子肥胖的风险，尼古丁可能会通过胎儿的下丘脑-垂体轴系统改变胰腺的功能来影响孩子的食欲，从而导致其肥胖；尼古丁导致肠道菌群种类及数量的改变也可能与孩子肥胖的发生有关。
单纯性肥胖占儿童肥胖的99%以上，大多是由于饮食过度、运动消耗过少，加上一些不良的生活习惯，导致能量摄入过多、脂肪堆积，从而引起体重增加。
这类食物包括：
● 含糖饮料、碳酸饮料；
● 甜品、果酱、蛋糕等甜食；
● 油炸或油煎类食物、奶油类食物、快餐等高油食物；
● 动物内脏、骨髓等高脂肪含量的食物；
● 各种酱料（如沙拉酱、花生酱、牛肉酱等），炒菜用油过多；
● 水果、坚果。
若以上食物摄入过量，会导致能量摄入偏多，脂肪堆积，引发肥胖。
“胖孩子”平时不喜运动，所以没有养成规律运动的好习惯；“胖孩子”因为膝关节疼痛、害羞、自卑等原因不会主动选择运动；随着学业压力增大，运动时间减少，很多初中、高中的体育课甚至经常被替换掉，进一步降低了“胖孩子”的活动量。
不良生活习惯包括：
● 饭后吃水果、甜点；
● 外出就餐更容易选择高油、高糖、高盐食物；
● 父母为了鼓励孩子奖励“洋”快餐；
● 花费更多时间看电视、打游戏、上网；
● 喜欢叫外卖；
● 喜欢熬夜（研究显示，每日睡眠时间低于6小时，肥胖发生率会升高，原因可能是睡眠不足影响瘦素、脂联素等激素分泌）。
以上不良生活习惯都会增加“胖孩子”的能量摄入，促使肥胖更迅猛地发生。
“胖孩子”常出现情绪化进食。如在产生兴奋、悲伤、生气等情绪时，孩子无法选择合适的方式排解、发泄，常常暴饮暴食，也易造成过度肥胖。
部分“胖孩子”患有哮喘、免疫性疾病或肾脏病等，在治疗过程中不可避免地会被使用激素类药物。如果长期、大剂量地应用激素类药物，会造成孩子发生向心性肥胖。一般停药一段时间后体重会自行恢复。
某些内分泌疾病，如甲状腺功能低下、垂体病变、下丘脑病变、肾上腺皮质亢进等患儿均有肥胖表现；Prader-Willi综合征、Laurence-Moon-Biedl综合征等均可表现肥胖等特征。这类型肥胖一般需要专业医师做专业检查进行鉴别诊断。
小贴士
不吃早餐的孩子更容易肥胖。
不吃早餐容易造成血糖降低，饥饿感会促使孩子摄入比实际需要更多的食物，而且孩子更喜欢选择那些高油、高糖食物，从而使能量摄入过量，体重增加；不吃早餐还会影响孩子的学习效率、活动量；不吃早餐，胆囊无法收缩排出胆汁，容易造成胆结石；不吃早餐还会阻碍胃结肠反射，导致便秘等。
有调查表明，经常不吃早餐的孩子，肥胖率高达16.8%，每周吃2～4次早餐的孩子肥胖率为13.5%，而每天都吃早餐的孩子肥胖率为11.8%。