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《伤寒来苏集》是《伤寒论注》《伤寒论翼》《伤寒附翼》三部著作的合称。取“来苏”者，《尚书》曾有“俟予后，后来其苏”之语，意为：等待我们的君王，君王来后我们的百姓得以复苏。来苏者，获得新生也。表示此书一出，犹似君王归来，百姓得以重生一样。其著作如同其名：琴声雅，尤如阳春白雪；韵味足，似同诗风雅颂；像巅峰，为古今注疏家中上乘之高论。是书又有醒世之能，使后人治伤寒，朱紫不混，鱼目不珍，通阅全书，可见作者的崇高医德与深厚的文学修养，是一位继承仲景遗志，发扬仲景学理之楷模。
《伤寒论注》共四卷，其成书自序中题己酉初夏，应是1729年，有学者说是1669年，与其生卒年份不符。该书逐条注疏《伤寒论》原文，但在编次上作了较大的改变。它首先集中原文中有关脉证大局的条文，作为总论。然后以六经分证，再在六经脉证里列出本经纲领性条文，作为总纲，最后以方类证，分为桂枝汤证、麻黄汤证等，分别集中该汤证的有关条文，而于每条条文之后，加以注疏与发明，议论明晰，颇能切合临床实用。
卷一、卷二为伤寒总论。包括太阳脉证，桂枝汤证，麻黄汤证，葛根汤证，大青龙汤证，五苓散证，十枣汤证，陷胸汤证，泻心汤证，抵当汤证，火逆诸证，痉湿暑证。卷三包括阳明脉证，栀子豉汤证，瓜蒂散证，白虎汤证，茵陈汤证，承气汤证，少阳脉证，柴胡汤证，建中汤证，黄连汤证，黄芩汤证。卷四包括太阴脉证，三白散证，少阴脉证，麻黄附子汤证，附子汤证，真武汤证，桃花汤证，四逆汤证，吴茱萸汤证，白通汤证，黄连阿胶汤证，猪苓汤证，猪肤汤证，四逆散证，厥阴脉证，乌梅丸证，白头翁汤证，热厥利证，复脉汤证，阴阳易证，诸寒热证。
《伤寒论翼》二卷，其自序题于甲寅春，应成书于1734年。上卷分别论述《伤寒论》大法、六经、合并、风寒、温暑、痉湿及平脉色；下卷系统分析了六经病的病机、脉证、治法和转归，并讨论了仲景的制方大法。在这部著作里，柯氏对《伤寒论》的关键性问题，提出了个人独到的见解，比较集中地表达了自己的学术思想。
《伤寒附翼》二卷，以六经类方，分析了六经方剂的用药意义和临床具体运用方法。在分析六经方剂之前，先列六经方总论，对本经各方剂作了综合性的介绍。