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1. 白色念珠菌（candida albicans）
白色念珠菌是上呼吸道的正常菌群，因此多数情况下痰样本中存在念珠菌仅表示来自口腔寄居菌群的污染而无临床意义；但有免疫缺陷或免疫抑制的患者可发生念珠菌的机会性感染（念珠菌病）。肺支气管的细针穿刺、支气管刷检、支气管肺泡灌洗等在病灶部位直接取样时，若发现念珠菌则有临床意义，细胞学报告上要给以诊断或描述。
念珠菌的形态：由圆形或椭圆形芽生孢子及细长而直的假菌丝组成，巴氏染色呈紫红色至灰棕色，HE染色呈蓝紫色。
2. 曲霉菌（aspergillus）（图8-43～8-46）
图8-43 曲霉菌（低倍、涂片、巴氏染色）
支气管肺泡灌洗液，为曲霉菌感染，注意分支状菌丝及坏死背景。曲霉菌的细胞形态特征，巴氏染色呈现浅褐色的分支，最重要的是菌支呈45°角分出。GMS染色可进一步确定。
图8-44 曲霉菌（高倍、涂片、巴氏染色）
支气管肺泡灌洗液，菌丝浅染透明且呈45°角的分支。
图8-45 曲霉菌（高倍、涂片、DQ染色）
支气管肺泡灌洗液，箭头所指为分支菌枝。
图8-46 曲霉菌（高倍、涂片、GMS染色）
支气管肺泡灌洗液，GMS染色展示了曲霉菌的褐色分支（蓝箭头）及球状扩张（红箭头）的孢子。
由此类真菌引起的感染称为曲菌病（aspergillosis）。正常人吸入曲霉菌的孢子不会发病，但有免疫抑制的人则可致病，会形成空洞性病灶，在X线影像上酷似癌，还可引起鳞状上皮的反应性改变而与恶性细胞极其相像，应注意鉴别。
曲霉菌的形态特征：巴氏染色呈浅褐色、分支状，菌丝呈45°锐角的分支，六胺银染色（Grocott-Gomori methenamine-silver stain，GMS）可进一步确定。
3. 皮炎芽生菌（blastomyces dermatitidis）（图8-47～8-49）
图8-47 芽生菌（高倍、涂片、巴氏染色）
芽生菌感染的支气管肺泡灌洗液，图中布丁状的圆形体（箭头）即为芽生菌，此为较常见的形态特征，背景可见炎性反应。
图8-48 芽生菌（高倍、液基、巴氏染色）
支气管肺泡灌洗液，形态特征是厚而具折光的双层细胞壁及宽基底的布丁样芽生孢子。
图8-49 芽生菌（高倍、液基、巴氏染色）
支气管肺泡灌洗液，较少见的分支状菌丝及球状孢子，液基制片未能显示炎性及坏死背景。
皮炎芽生菌产生的感染称为芽生菌病或酵母菌病（blastomycosis），也称为Gilchrist病，此类真菌的感染表现为化脓性和肉芽肿样慢性炎症。病人多是由吸入被皮炎芽生菌污染的土壤微粒而感染，感染灶在X线影像上很像癌。
细胞学形态特征：圆形或卵圆形芽生孢子，直径8～15μm，厚壁，单芽，芽颈粗，无荚膜，中心为颗粒状酸染物质，通常散在分布。GMS染色及PAS染色（periodic acid-Schiff stain）可进一步确诊。
4. 新型隐球菌（cryptococcus neoformans）（图8-50～8-52）
图8-50 新型隐球菌（高倍、涂片、巴氏染色）
支气管肺泡灌洗液，为类似芽生菌的透明圆形物（箭头）及双层厚壁结构。“泪滴”状的改变。新型隐球菌与芽生菌的区别在于前者较小、基底较窄，有“泪滴” 样改变，显现单个的芽状结构；特殊染色PAS或Mucicamine、Alcian Blue可进一步确诊。
图8-51 新型隐球菌（高倍、涂片、巴氏染色）
支气管肺泡灌洗液，箭头所指为透明圆形物，有时可见到“泪滴”状的改变（插图，DQ染色）。
图8-52 新型隐球菌（高倍、涂片、GMS染色）
支气管肺泡灌洗液，“泪滴”样深染的圆形物（箭头），GMS染色可确诊。
隐球菌病（cryptococcosis）是一种亚急性或慢性真菌病，多因吸入被鸟类粪便污染的土壤微粒而感染，但也可为职业感染（如医务人员），多见于免疫抑制的患者，也可见于无明显免疫抑制的患者。原发灶在肺部，而常常累及中枢神经系统。早期病变呈胶冻样，晚期病变为肉芽肿性。中枢神经系统病变主要为脑膜炎。肺部病变时患者可以无症状或表现类似恶性肿瘤的症状，如体重减轻、血性痰、胸痛、慢性咳嗽、发热等。X线胸片可显示单个或多个病灶，在支气管取材的样本中可找到病原菌。
细胞学形态特点：为圆形或卵圆形的酵母菌，直径4～7μm，单芽，厚壁，基底较窄，有“泪滴”样形状，具折光性的荚膜，荚膜厚3～5μm；HE染色呈淡红色，PAS染色、黏液卡红（mucicamine）染色及奥辛蓝（acian blue）染色可进一步确诊。
5. 荚膜组织胞质菌（histoplasma capsulatum）（图8-53）
图8-53 芽膜组织胞质菌（高倍、涂片、巴氏染色）
支气管肺泡灌洗液，细胞学形态特点：巨噬细胞胞质中见到数个圆形或椭圆形球状物。有时巴氏染色很不容易识别。在GMS染色中可清楚展现透明外壳包绕的多个圆形球状物。
荚膜组织胞质菌引起的感染称为组织胞质菌病，也是由于吸入被鸟粪便污染的土壤微粒所致。大部分的感染可以无症状，也可自行消退。在X线影像上，其病灶呈“钱币样”酷似恶性肿瘤；发生在免疫抑制性患者时，可很快引起全身系统性感染。
荚膜组织胞质菌感染时，几种支气管的细胞学样本中都可能找到该病原体。
细胞学形态特征：在巴氏染色中可见内部含有多个小圆形体的球状物，但有时很不容易辨认，用GMS染色可较清楚地看到由透明外壳包绕的多个圆形生物体。
细胞学方法是诊断病毒感染较为快速的手段。
1. 单纯疱疹病毒（herpes simplex virus）（图8-54，8-55）
图8-54 单纯疱疹病毒引起的细胞改变（中倍、涂片、巴氏染色）
支气管肺泡灌洗液，特点为多个毛玻璃样核镶嵌在一起，核染色质边聚，核膜增厚。
图8-55 单纯疱疹病毒引起的细胞改变（中倍、涂片、巴氏染色）
支气管肺泡灌洗液，与图8-54同一病例，多个毛玻璃样核镶嵌，单纯疱疹病毒引起的细胞改变，核染色质边聚，核膜增厚。
可见特征性的多核细胞，核毛玻璃样、多个聚积、镶嵌排列，染色质边聚致核膜增厚，尚可见核内包涵体。有时异型、多形、巨大的核内包涵体会被误认为是核仁，伴修复上皮细胞及坏死背景有可能被误诊为恶性肿瘤。
细胞形态特征：多核镶嵌、毛玻璃样核、核染色质边聚。
2. 巨细胞病毒（cytomegalovirus，CMV）（图8-56）
图8-56 巨细胞病毒引起的细胞改变（中倍、液基、巴氏染色）
支气管肺泡灌洗液，箭头所指圆形物为巨细胞病毒引起的细胞核的特征性改变——核内包涵体伴周围空晕。
被CMV感染的细胞胞体增大，胞质内或核内可见嗜碱性（偶尔也可为嗜酸性）包涵体伴周围空晕，偶尔多核，但核排列不拥挤。CMV常可伴随卡氏肺囊虫感染。
卡氏肺囊虫（pneumocystic carinii，PCP）：是一种机会性感染的寄生虫，常见于免疫抑制的患者，临床症状包括干咳、发热及呼吸困难。
细胞学形态特征：在巴氏染色中呈无定形的红染的泡沫样物，GMS染色有助于确诊。（图8-57～8-60）
图8-57 卡氏肺囊虫（低倍、液基、巴氏染色）
卡氏肺囊虫感染的痰样本，图示无定形泡沫样结构为卡氏肺囊虫。其形态特征在巴氏染色中显现一种无定形的、红染的泡沫样物，GMS染色即可确诊。
图8-58 卡氏肺囊虫（高倍、液基、巴氏染色）
支气管肺泡灌洗液，箭头所指泡沫样无定形结构为卡氏肺囊虫。
图8-59 卡氏肺囊虫（中倍、涂片、DQ染色）
支气管肺泡灌洗液，风干样本DQ染色显示的泡沫样结构。
图8-60 卡氏肺囊虫（中倍、涂片、GMS染色）
支气管肺泡灌洗液，为深褐色的一堆小球状物组成。GMS染色可进一步确诊。