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检查每一例病例是否已完成，如细胞病理医师已签字，并发出报告，这时就可以将细胞涂片、细胞块组织切片和特殊染色切片及相关文件，按要求归档保存。
（1）确保患者的涂片样本及报告不能随意公开。
（2）对细胞病理涂片和报告的借阅必须通过办公室办理。在任何情况下，如果没有合适的理由，报告和涂片不能对任何人公开。
（3）所有细胞制片应保存在贮藏橱内。
（4）任何人需要借阅已存好的制片，都必须填写申请单并签字，交给负责人，领取细胞制片。
（5）应及时归还所借阅的制片，并要求负责人签收。负责人应保持记录，让其他人知道该病例所有的涂片是否已归档。
（6）登记记录必须保留2年。
（7）质控记录必须保留10年。
（8）细胞病理报告记录必须保留10年。
（9）细胞制片应保存至少5年。
（10）所有未转移至玻片上的样本必须丢弃于生物垃圾桶内进行高压消毒；已保存在CytoLyt和PreservCyt保存液中的细胞样本必须集中存放；所有这些样本均由有营业执照的机构来收集和处理。
（11）所有样本必须保存至报告最终完成为止才能清理。