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麦克阿瑟马上就感觉到自己的计划会遭到否决，6月18日他写信给马歇尔：“我坚定不移地认为，绕过菲律宾横渡太平洋直接进攻台湾岛是不可能的……菲律宾成千上万的游击队员正在敌后进行艰苦卓绝的战斗，如果我们绕过菲律宾，不尽早解救美军的被俘人员、侨民和忠诚的菲律宾人民，任其被日军欺凌宰割，那么将导致严重的心理反应，等于确认日本关于美国抛弃菲律宾、不愿让美国人流血去拯救他们的宣传是真实的，美国不信守尽早解救菲律宾的诺言，会在远东所有民族中失去威信，在今后许多年都会对美国产生不利影响……”他请求马歇尔同意他去华盛顿向参谋长联席会议当面陈述自己的计划，进行审核。
马歇尔很清楚菲律宾对麦克阿瑟的特殊意义——麦克阿瑟是美国少有的主张亚洲为先战略的高级将领，他曾担任过驻菲律宾美军司令、菲律宾总督，甚至还得到菲律宾陆军元帅的军衔，太平洋初期因为美军在菲律宾的失败无法避免，罗斯福总统出于保护他的目的将他从菲律宾召回，离开菲律宾之前，麦克阿瑟发誓：“我还会回来的！”可见，菲律宾对麦克阿瑟而言，不但是政治、军事上的考虑，还关系到名誉和信义。所以马歇尔告诫麦克阿瑟：“我们必须谨慎地不要让个人感情和菲律宾的政治考虑超过我们伟大的目标，这个目标就是早日结束对日战争。”同时马歇尔还特别提醒麦克阿瑟“绕过并不是抛弃的同义词”，应该说马歇尔的答复算是很客气了，面对马歇尔这么温和的拒绝，麦克阿瑟还是不管不顾地在7月将进攻菲律宾的作战计划呈报给了参谋长联席会议。没想到，尼米兹对这个计划居然也表示了部分支持，因为尼米兹认为菲律宾在战争最后阶段对日本本土进攻时具有举足轻重的作用，所以占领菲律宾是非常必要的。不过他和麦克阿瑟的区别就在于，尼米兹认为不需要占领整个菲律宾，而只需要占领菲律宾2 400多个岛屿中两三个岛屿就足够了。
两位战区司令的意见如此一致，也让参谋长联席会议不得不慎重考虑了。
这时，还有一位重量级的人物出场了，他就是美国总统罗斯福。
7月26日，罗斯福乘坐“巴尔的摩”号重巡洋舰抵达夏威夷，当面听取尼米兹、麦克阿瑟就太平洋战场的相关战略问题的汇报。
罗斯福考虑的不仅仅是战场上的政治、军事问题，他还要考虑国内的选战——就在前一天的7月25日，罗斯福刚刚被提名参加第四任总统竞选。而麦克阿瑟则是一个潜在的竞争对手，因为共和党曾经考虑推举麦克阿瑟作为总统候选人。而且麦克阿瑟还在私下表示，如果高层驳回了他的菲律宾进攻计划，他就会辞职。一旦麦克阿瑟辞职，作为一个深受美国民众爱戴的英雄式人物，一个极受舆论关注的新闻焦点人物，而且还是罗斯福反对派的政治人物，麦克阿瑟在选举的关键时刻辞职，必将给罗斯福带来相当不利的负面影响。
直到麦克阿瑟在一封信里公开批评了罗斯福，引起了一场政治风暴；而在这之前，麦克阿瑟一直是一个几乎默不作声的总统候选人，但民意调查显示，他的选举成绩并不差。不过这场政治风暴最终让麦克阿瑟宣布自己不是候选人。这才让罗斯福大大松了一口气，不过这也从一个侧面反映出麦克阿瑟在广大美国民众心目中还是很受支持的，这也不得不让罗斯福有所顾忌。
▲ 美国陆军参谋长马歇尔上将。
很多人在谈及这一事情时，总认为是麦克阿瑟用他过人的口才说服了罗斯福，但实际上并不是这样，作为见惯了政坛风雨的政治家，罗斯福怎么可能被几句话打动？他最终的决定绝对是多方面综合考虑的结果，对于这一点，麦克阿瑟很清楚，他在启程前往珍珠港时就对手下说，这次会面“纯粹是政治性的”，这是罗斯福在大选前的关键时刻，必须让美国人民更加清楚地认识到他是美国军队的最高统帅，这就是一场政治秀。
没有跟随总统前往珍珠港的参谋长联席会议成员也很清楚这一点，很担心罗斯福会受到压力而倾向麦克阿瑟，所以金上将还在罗斯福前往珍珠港之前，先一步视察珍珠港，并和尼米兹交换了意见。
7月26日，麦克阿瑟乘坐自己的“巴丹”号专机从西南太平洋战区司令部所在地布里斯班飞抵珍珠港，他落地时比罗斯福乘坐的军舰抵达珍珠港要早了一个小时，但他却没有赶到码头迎接，而且在和总统见面时，穿着非正式的飞行夹克，而不是正式的制式军服，显然不够正规，对总统也不够尊重。
看到麦克阿瑟这样表现，罗斯福的陆海军总司令参谋长，也是事实上的参谋长联席会议主席威廉·莱希（旧译作李海）海军上将甚至担心这可能破坏这次很不容易才召开的会谈气氛，但他显然过虑了，罗斯福的气量远比他想的要大。在太平洋舰队司令部军官俱乐部豪华别墅举行的欢迎宴会上，气氛相当热烈而融洽。宴会后，罗斯福、莱希、尼米兹和麦克阿瑟开始会谈，罗斯福开门见山表示这次会谈的目的就是要“决定太平洋战争下一阶段的行动计划”。
尼米兹首先发言，他说明了利用台湾岛作为进攻日本本土的前进基地的优势，同时也表示，摧毁日军在菲律宾航空基地是进攻台湾岛的重要前提，但他也强调，这并不代表着需要占领整个菲律宾。
▲ 麦克阿瑟对菲律宾是志在必得。
麦克阿瑟的发言就要激情多了，他认为将1700万菲律宾人民从日军的铁蹄下解放出来是美国义不容辞的“道义义务”，同时也能为进攻日本本土提供比台湾岛更有利的前进基地，如果绕过菲律宾，不论是政治上还是军事上都会带来灾难性的后果。
“如果绕过菲律宾，美国舆论会谴责您，总统先生，而这一谴责是有道理的。”
讨论一直持续到第二天上午，罗斯福想从中了解两位战区司令对于菲律宾在最后进攻日本本土的作战中的作用，存在多大的分歧。尽管罗斯福还没有宣布自己最后的决定，但尼米兹已经意识到总统将会站在麦克阿瑟一边，而麦克阿瑟也清楚自己的计划得到了总统的支持。
当麦克阿瑟的专机刚刚从珍珠港机场的跑道上腾空而起，麦克阿瑟就按捺不住心头的喜悦和得意，对自己的参谋长理查德·萨瑟兰少将说：“我们赢了！”一回到布里斯班的司令部，麦克阿瑟就立即向手下的参谋人员宣布，总统已经批准了菲律宾作战计划。
▲ 从左到右：麦克阿瑟、罗斯福和尼米兹。
罗斯福返回美国之后发表了一个简短的演讲，公开宣布“我和麦克阿瑟将军的意见完全一致”。对于日本来人说，这是一个再明显不过的信号，美军的下一个进攻目标无疑就是菲律宾。