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生态补偿涉及不同的学科和领域，研究成果却多集中于技术操作层面，如设计补偿项目、确定补偿标准、选择补偿方式等，国内外理论研究内容比较丰富，虽然达到了介绍生态补偿现象、推广生态补偿项目的目的，但至今尚未形成一个以诠释生态补偿本质为切入点的全面系统性理论框架，考虑到生态问题的复杂性，本书借鉴唯物史观方法论，从人与人、人与自然关系的双螺旋结构着手，建立起社会主义市场经济背景下的生态补偿政治经济学分析框架。
以往的生态补偿概念，主要集中在一种解决环境问题外部性的手段方面，国内外学者们的观点也大多围绕这一思想而提出，研究内容从生态补偿设计时考虑的信息问题、参与者特征、合同类型、目标选择等因素，到生态补偿执行在不同国家和地区背景下的差异化表现，文献数量比较丰富，然而，现今的生态补偿研究呈现出“碎片化”特点，集中于技术操作层面，缺乏完整系统的分析框架。如各种分析方法越来越前沿，整体系统分析能力却止步不前。国外生态补偿的案例研究比较丰富，对补偿项目的实践推广意义重大，为在实践层面探讨生态补偿实施效果、在理论设计层面优化生态补偿内容框架提供了丰富的素材。同时，国内相关研究也表现出案例研究倾向，对各种生态补偿具体项目的分析几乎占据了文献的大多数，虽为完善生态补偿理论奠定了基础，且具有一定的实践价值，然而，国内外文献中关于生态补偿本质问题的研究却显得很单薄或很少有学者关注。
鉴于当前生态补偿问题研究表现出的不足，下一阶段生态补偿研究亟须寻找新的视野、开辟新的领域，从本质层面、历史视角、辩证逻辑探索生态补偿的理论尝试不失为一种选择。
（1）从本质层面探讨生态补偿，而不是把它仅仅看作一种简单的政府干预手段或者市场方式。生态补偿现象的研究已经很丰富，不妨深入挖掘生态补偿本质层面的理论内容，把生态系统作为起点，借鉴唯物史观方法论，在梳理和阐述马克思经典理论的基础上，系统有层次地“解剖”生态补偿这种经济活动，从全新的视角构建社会主义市场经济框架下的生态补偿理论。
（2）从历史视角看待生态补偿，而不是把它视为一种既定的经济现象或经济手段。自人类社会出现以来，人们对自然的开发和利用程度不断提高，尤其是工业革命以及在其基础上建立起来的资本主义生产方式的作用，更是掀开了人类追逐经济利益最大化，肆意掠夺自然，完全无视自然生态环境的序幕，由此引发了人类发展史上最严重的资源短缺、环境污染和生态失衡问题，并于20世纪50—70年代集中爆发于西方发达国家，生态治理便成为世界各国走出困境的必然选择，生态补偿因此受到世界各国的青睐。
（3）用辩证逻辑思考生态补偿，而不是把它当作一种单向度的工具。生态补偿是一个复杂问题，分析和理解其二重性（自然属性和经济属性）是剖析其本质的一把钥匙，自然补偿主要解决生态系统依靠自身净化和调节能力，维持自身平衡状态的补偿，经济补偿则是指人类主动协调相关主体利益、采取相关行动，为减少或遏制生态恶化而付出的努力。了解和辨析自然生态补偿与经济生态补偿的联系与区别，从实践出发探索灵活性的补偿形式，并为不同补偿形式的顺利实施创造条件，是生态补偿理论研究的重点，也是未来实践推广的方向。
（1）把生态补偿研究置于唯物史观视野之中。本书不是简单地延续以前学者们对具体生态补偿政策、工具、案例等毫无内在联系的“碎片化”研究思路，而是把生态补偿问题嵌入人与自然和人与人交互作用的经济社会发展历史进程中，从辩证的、历史的、社会的、发展的、“五位一体”的视角，把握和处理生态补偿问题，通过构建整体性、系统性生态补偿理论框架，把马克思主义与人类命运、与中国大多数人的利益“水乳交融”地结合在一起，为中国特色社会主义解决具体问题探索一条可行的新路。
（2）把生态补偿置于生态系统、生态危机、生态治理的系统框架之中。现阶段，生态补偿正如火如荼地在世界各国实施着，中国的生态补偿在开展时间上落后于发达国家，健全的生态补偿制度、完善的生态补偿机制仍在进一步摸索和试点中，本书从历史逻辑的视角，参考“绿色（生态）、资本（经济）、网络（生产方式）、制度（政治、政府）、文化”思路，在界定生态补偿内涵、揭示生态补偿本质、指明生态补偿趋势等方面进行了诠释。
（3）从自然科学和社会科学交叉的视角研究生态补偿。马克思主义政治经济学分析方法或范式采用一套系统规范的理论分析框架以及贯穿始终的研究方法，把马克思主义政治经济学关于人类劳动功能的理论，雇佣劳动创造资本价值及其增殖的理论，资本流通理论以及对资本进行物质补偿和价值补偿的理论，直接运用到对生态、生态价值、生态问题、生态治理、生态资本、生态补偿这一系列范畴和理论的研究中，构建起生态补偿理论的马克思主义政治经济学分析框架，为中国在发展理念和文化教育方面普及生态补偿思想、在制度和政策层面设计生态补偿项目、在实践中推行生态补偿提供一种可借鉴的思路。
（4）彰显政治经济学的现实解释力。生态补偿是中国生态文明建设的重要手段，从马克思主义政治经济学视角分析生态补偿，是灵活使用政治经济学方法分析经济问题，增强政治经济学时代感，提高其对现实问题洞察力和对未来发展影响力的有益尝试，并为在社会主义市场经济背景下，实现“中国梦”、建设“美丽中国”提供一种方法论参考。