神农架森林密布,林间植被丰富,落叶和枯萎的植物,源源不断的向土地输送养分,所以土壤十分肥沃,这为很多植物提供了生长条件,在丛林深处随处可见多种珍稀物种,是名符其实的“物种基因库”。
神农架已发现的各类植物有三千七百多种,属于国家一级保护植物的一种,即珙桐,又名鸽子树,是3世纪遗留下来的世界著名且稀有的孑遗植物。国家二级保护植物有16种,如连香树、香果树、鹅掌揪等。国家三级保护植物有23种,如秦岭冷杉、天麻、青檀等。
此外,在神农架的森林深处,还生长着很多野生中草药,其中的头顶一颗珠,七叶一枝花,江边一碗水和文王一支笔,被称作“四绝”,令人叹为观止。