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刘老不仅善于继承前人学术经验，亦注重融会新知。他主张用现代科学技术来研究中医。早在20世纪70年代，先生就提出中医的扶正祛邪与免疫有关，从提高免疫、调节免疫的角度对肿瘤、自身免疫性疾病进行了大量临床与实验研究，并以此为指导治疗肿瘤、类风湿关节炎、甲状腺功能亢进症等病取得满意的疗效。研制以益气健脾为法的固表防感冲剂，在临床预防感冒及减少慢性支气管炎、肺源性心脏病、风湿性心脏病急性发作等，疗效显著。他认为：中医不应固步自封，主张古为今用、西为中用；中医师要学西医，但不用西药，而须以中医的思维方法为指导，来运用现代医学知识，借他山之石以攻玉。刘老曾说，只要中医根底深，就能立得住，就不怕异化，更能为己所用，更快地发展壮大。
先生在学术研究中敢于创新，不落窠臼。20世纪80年代初，被聘为硕士生导师，承担研究所研究生班及全国中医内科医师培训班的教学工作。先生深入研究了中医热病学说的发展沿革，撰成《温病源流论》一书。先生在书中系统阐述了温病学发展沿革的历程，厘清了伤寒、温病之争的诸多问题。书中提出的许多观点，即使在今天亦十分新颖，具有重要的学术价值。
1985年协助李聪甫，承担了国家中医药管理局中医古籍整理重点课题“《中藏经》的整理研究”，首次提出了《中藏经》以脉证形气决死生、以脏腑辨证为中心的学术思想，完成了《中藏经校注》、《中藏经语译》，填补了《中藏经》整理研究的空白，该研究获国家中医药管理局科技进步奖二等奖。该书的研究，对刘老形成以脏腑经络为基础的辨证思维方法有较大影响。