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体育卫生工作，是学校教育工作的重要组成部分，是学校全面贯彻国家教育方针不可缺少的内容之一，同时，也是培养学生德、智、体、美、劳全面发展的重要组成部分。总之体育卫生工作非常重要，每一个学校管理者都必须对此予以高度重视，遵循以下原则进行管理。
国家的教育方针，是使学生在德、智、体诸方面全面发展。这就是说，要把德、智、体放在同等重要的地位。长期以来，相当普遍的现象是轻视体育，或者口头上重视，行动上轻视。这是有违国家教育方针的，也不符合青少年全面发展的需要。
青少年学生正值长身体、长知识的重要时期，身体发育至关重要。这段时期学生身体发育状况如何，对学生将来能否健康地为祖国工作，有决定性的意义。我们不能只看到“长知识”而不顾及“长身体”。我们应爱护下一代的健康。那种用牺牲学生的健康去换取文化知识的做法，是对下一代不负责任的表现，是违反国家和民族的长远利益的。
另外，没有好的身体，也必然严重影响学生文化知识的学习和道德品质的成长。研究表明，健康的身体是智力发展的重要前提与条件。而健康的身体，除了先天因素以外，主要是通过后天的营养和体育锻炼来获得的。
因此，学校领导者必须正确处理德、智、体三者之间的关系，摆正它们的地位。在思想上把它们同等重视，做到“三育”一起抓。
体育和卫生虽是两项不同的工作，但它们的目标是一致的，都是为了促进学生身体健康，增强学生体质。体育是从锻炼方面增强学生的体质，卫生是从保健、医疗方面保护学生的健康，只注意体育锻炼，不讲究卫生，不可能达到强壮身体的目的；只讲究卫生，不锻炼身体，体质也不可能增强。
因此，两者必须紧密结合，才能相辅相成，促使学生的身体健康成长。两者结合，首先要体现在两者的专职机构——体育教研组和卫生室，在工作上要互相协调，互相支持。
校医在必要时可参加体育组的教研活动，对体育教学实行医务监督。另外，对学生的体格检查，也要互相配合。学生的身高、体重、胸围、肺活量的检查，由体育组负责；其他健康方面的检查，由卫生室负责。
体育组要及时向卫生室了解体格检查的结果，以便根据学生的身体素质安排体育教学活动，使体育教学建立在科学的基础上。其次，两个专职机构的专职人员——体育教师和校医要互相学习，熟悉对方的工作内容和要求。体育教师应懂得一般的医疗卫生知识，校医应懂得体育锻炼的一般要求和方法，这样才能合作得好。
体育和卫生工作，都要有一个主辅的问题，就是要明确以什么为主，以什么为辅。这样，工作才不会偏离轨道而富有实效。学校体育必须面向全体学生，以普及为主。所谓普及为主，就是要开展群众性的体育活动，使每个学生都积极参加，而且要形成制度，形成风气。
对免试体育的病、残学生，也要采取适合他们特点的措施，促使他们健康成长。体育要在普及的基础上提高，即在群众性的体育活动中，发现有特长的学生，为他们创造各种条件着重培养他们。
运动队员平时是各班体育活动的骨干，校际比赛时则从中选择优秀人才组成学校的代表队。只抓普及，不抓运动队的训练，便不可能提高学校的运动水平；只抓运动队的训练，忽视群众性的体育活动，将挫伤大多数学生参加体育锻炼的积极性；至于既不抓普及，也不抓提高，则更是错误的。因此，要主辅并重齐抓。
学校卫生工作，应以预防为主，以治疗为辅。所谓预防为主，就是要向学生进行卫生知识教育，使学生养成良好的卫生习惯；要积极开展群众性的爱国卫生运动，搞好环境卫生，保持校园整洁；要对学校各项工作进行卫生监督；要搞好疾病特别是季节性疾病的预防工作；定期组织师生进行体格检查，但是对一些小病小伤，在条件允许的情况下，要积极治疗，不应借口“预防为主”而不管。
体育锻炼和卫生要求，必须讲究科学。也就是说，要根据学生的年龄特点、性别特点和个性差异，区别对待，循序渐进。例如体育课和课外体育活动，要注意学生的生理特点，科学地进行锻炼，运动量由小到大，逐步增加；运动技巧，由易到难，逐步提高。
小学生和初中学生在身体发育方面有很大差别，要严格按照体育教学大纲和国家体育锻炼标准进行，从学生的实际运动水平出发，不可随意增加运动量，随意增加难度，不可搞突击锻炼，在体育活动中出现的各种伤害事故，大都是违反科学造成的，学校领导者不可不高度注意。
由于生理上的不同特点，男女学生也有很大差异。尤其是初中的学生，特点更为明显，有条件的学校应实行合班男女分开教学，女生体育课最好由女教师担任，更能照顾女生的特点。
学校卫生工作要注意研究青春期的生理特点，向学生传授这方面的科学知识；要研究多发病、常见病的发生发展规律，提出防治措施。
另外，体育卫生工作还要讲究时效性。体育卫生的时效性表现在工作效果不是在短时间内能够看到的，贵在坚持。拿个人体育锻炼来说，如不日复一日的坚持，今天练，明天不练，时断时续，哪能收到增强体质的效果。
从学校来说，坚持才能形成风气。凡是体育活动开展得好的学校，秘诀就在于坚持。因此，无论是酷暑严寒，还是晴阴雨雪，体育锻炼不能中断。
卫生工作也是如此，如果只有“大扫除”，只有临时突击的“卫生运动”，仍然不可能保持校园整洁。从个人来说，要坚持日常的卫生工作，养成良好的卫生习惯，才能保护身体健康。从学校来说，只有把卫生工作经常化、制度化，不搞形式主义，才会有一个整洁的环境。凡是卫生工作搞得好的学校，莫不在于坚持。因此，体育卫生工作，一定要做到：坚持、坚持、再坚持。