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虽然许多旧史学家，曾经把黄帝说成是中国古代的一个帝王，而如今一般认为，黄帝并非专指一个人，而是中国原始社会末期的一个氏族，居住在中国西北地区，到了春秋时候，这个氏族又称为“华族”，就是中华民族的始祖，也是汉以后“汉族”的祖先。正因为黄帝氏族是华族的始祖，它的文化对华族的发展产生了重要影响，所以后世都以自己是黄帝子孙为荣，而且为了追本溯源，也常把一切文物制度都推源到黄帝，托名为黄帝所创造。所以《内经》冠以“黄帝”之名其实也是托名而已。古代学者为了使自己的学说更容易被世人所接受，往往将其著作冠以“黄帝”而取得重视。这种托名风气在当时的医学领域里极为突出，这无非是为了推广普及医药知识的需要。
在中国唐代以前的古典医学著作中，喜欢把重要的医书以“经”为书名，除《内经》外，还有《难经》《神农本草经》《针灸甲乙经》《中藏经》等。“经”字的含义，就是常道、规范的意思。医书名“经”，无非是说明本书是医学的规范，医者必须学习和遵循。“内”与“外”相当于现代图书的“上册”和“下册”，并无深意。
《内经》后来以《素问》《灵枢经》两部书的形式呈现于世。《素问》书名的含义，历来医家解释颇不一致，一般认为是古人从天地宇宙的宏观出发，运用精气学说和阴阳五行学说，解释和论证天人关系及人的生命活动规律和疾病发生发展过程，有陈源问本之意。
至于《灵枢经》之名的含义，由于《灵枢经》之名文献上首见于唐代王冰次注《黄帝内经素问》中，所以不少学者认为《灵枢经》的命名可能与王冰崇信道教有关。
历代的书籍目录均没有明确记载《内经》的作者，但从《内经》的相关内容来看，《内经》应非一人一时之作。《内经》成书前存在一批古代医学文献和众多古代医家。作为中医奠基之作的《内经》不是凭空出现的，是由古代众多医家的宝贵经验积累沉淀而成。在《内经》成书之前，不同的学术观点、学术论文，甚至学术流派，就已先后产生并予流传，经过整理、加工、补充和完善而编辑成册，遂成《内经》一书。因此，可以说《内经》是春秋战国乃至西汉各医家医学理论及治疗经验的总结，是一部众多医家论文的汇编。当然该书成编后，随着年移代革、辗转传抄，也有一些增删移易。