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目前已知人、鼠共患的疾病达160多种。按其病原体可分为：病毒性疾病，如流行性出血热、森林脑炎等；立克次体，如恙虫病、鼠型斑疹伤寒、斑点热等；螺旋体病，如钩端螺旋体病、蜱传回归热等；细菌性疾病，如鼠疫、鼠咬热等；寄生虫病，如微小膜壳绦虫病、缩小膜壳绦虫病等，其中鼠疫、流行性出血热等10余种最为重要。
由老鼠传播的疾病，曾给人类造成巨大灾难，如鼠疫在历史上曾有过3次世界范围大流行，死于鼠疫的人数大大超过世界大战中的死亡人数。14世纪鼠疫大流行，导致东罗马帝国的衰亡。我国于1900～1949年有过6次大流行，死亡110余万人。