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在全球，10%～30%的上呼吸道感染由HCoV-229E、HCoV-OC43、HCoV-NL63和HCoV-HKU1四类冠状病毒引起，在造成普通感冒的病因中占第二位，仅次于鼻病毒。感染呈现季节性流行，每年春季和冬季为疾病高发期。潜伏期为2～5天，人群普遍易感。主要通过人与人接触传播。
严重急性呼吸综合征（severe acute respiratory syndrome，SARS）由人感染SARS-CoV引起，潜伏期通常限于2周之内，一般约2～10天。人群普遍易感。SARS患者为最主要的传染源，症状明显的患者传染性较强，潜伏期或治愈的患者不具备传染性。自2004年以来，全球未报告过SARS人间病例。
中东呼吸综合征（Middle East respiratory syndrome，MERS）是一种由MERS-CoV引起的病毒性呼吸道疾病，潜伏期为2～14天，人群普遍易感。单峰骆驼是MERS-CoV的主要储存宿主，且为人间病例的主要传染源，人与人之间传播能力有限。