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元朝建立以后，把军队分为宿卫的禁军和驻防各地的镇戍军。宿卫军除怯薛以外，又建立五卫亲军，每卫设亲军都指挥使，保卫都城。后又迁发各族人民，先后建立了二十卫亲军，驻守近畿和腹里（包括今河北、天津、河南、山东、山西及内蒙古的一部分）各地。镇戍军有四类：蒙古军，皆由蒙古人组成，屯戍于河洛、山东，守卫天下腹心之地；探马赤军，由契丹、女真诸部族组成；汉军，由签发北方的汉人组成，戍守江淮以南地区；新附军，由新归附的“南人”军队（南宋军队）组成。镇戍军遍驻全国各地，组成一个全国范围的军事统治网。此外，还有所谓乡兵，皆在当地驻守。
在蒙古贵族南下征战的过程中，北方的农业经济遭到严重破坏，元世祖统一全国后采取了一些恢复经济的措施，北方农业逐步得到恢复。据《元史·兵志》记载，各地驻军都实行屯田制度，归枢密院管辖的军事屯田，有左卫屯田、右卫屯田、中卫屯田、前卫屯田和后卫屯田。中卫屯田的地域包括了今天津地区在内。元世祖至元四年（1267），于武清、香河等县设置军屯，屯田军数为二千人，为田一千三十七顷八十二亩。后因各屯地界相去百余里，往来耕作不便，遂于至元十一年（1274）迁于河西务、荒庄、杨家口、青台、杨家白等处。成宗大德元年（1297）十一月，又调发真定军人三百名于武清县崔黄口增置屯田。由大司农所管辖的屯田机构，有营田提举司，其开始建置的时间不详，其设立之处所在大都之武清县，所辖军户二百五十三，民户一千二百三十五。垦田三千五百二顷九十三亩。据《元史·地理志》记载，于至元十三年（1276）将槨阴县升为槨州，下辖武清、香河（后并入宝坻县）二县。由此可知，今天津武清、宝坻地区在元代乃是重要的军事屯田地区。
此外，今天津地区在元代还是供应大都粮食的重要储存地和转运站。据《元史·百官志》记载，元朝先是在京师设京畿都漕运使司，后于至元二十四年（1287）内外分置两运司，京畿都漕运使司只掌管在京诸仓出纳粮斛，下辖十四仓，其中设于直沽的粮仓称为广通仓。由此可知，今日的天津地区在元代无论在军事方面还是经济方面，均占有重要地位，发挥着重要作用。