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异常阴道镜表现发生率大约为3.6%。宫颈上皮及其下间质的结构决定了阴道镜的表现，对阴道镜检查的各种表现做出适当的解释需要准确把握宫颈病变的组织病理学。
不同的组织学变化会呈现不同的阴道镜下图像。初始轻微改变是宫颈柱状腺上皮移位（外翻），原本宫颈外口鳞状上皮区域出现腺上皮。移位的腺上皮通常会被新生的鳞状上皮全部或至少部分取代（化生），这是宫颈上皮性病变的重要基础。新生的鳞状上皮可能是正常的、棘皮样的（良性肥厚性改变）或者具有不典型性的。阴道镜医生需要采用专业术语对不同生物学行为及重要性的病变进行评估。