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对于自闭谱系障碍，研究者和医学专家一直试图寻找一种有效、安全且可接受的医学和生物医学治疗方法。自闭谱系障碍儿童的家长们也非常希望能研发出可以改善自闭谱系障碍症状的有效药物，但目前获得美国食品和药物管理局（FDA）核准的只有一种药物——利培酮。利培酮主要是用于改善自闭谱系障碍患者的攻击性、自伤、发脾气等问题的，对自闭谱系障碍的核心缺陷即社会交往、沟通、刻板行为等没有作用，也就是说并无法治疗自闭谱系障碍的核心缺陷。
还有些研究者基于神经递质的研究采用一些降低血液中5-羟色胺水平的药物（如芬氟苯拉明）来进行治疗。虽然此类药物能增加自闭谱系障碍患儿目光接触、社会知觉和对学习任务的注意维持，提高IQ测验分数，减少多动或重复行为，改善睡眠状态等，但是这类药物在患儿的交往行为方面没有明显的作用。
同时，这类药物还存在一些副作用，如易怒、嗜睡、不自主地挥手和食欲减退等
。并且，如果药物治疗使用不当（如长时间大剂量用药、中间没有间歇等），还可能会带来一些其他的副作用，如停药时出现反弹，使行为症状变得更加强烈。
由于自闭谱系障碍病因复杂，且个体差异较大，迄今为止还没有特效药物出现。国际研究普遍认为，治疗的关键在于通过特殊教育训练和行为干预，提高自闭谱系障碍患者在日常生活中自理、认知、社会交往及适应社会的能力。由于自闭谱系障碍的表现非常复杂，因此对自闭谱系障碍患者的教育、康复、干预方案，要建立在对自闭谱系障碍个体的心理发育水平和行为、需要、社会适应能力进行全面评估的基础上，采用适合于自闭谱系障碍个体的富有个性化的教育手段、康复计划或干预策略，进行长期的系统的教育、康复训练。目前的一些药物治疗也是用于教育康复的辅助手段。自闭谱系障碍患儿可能伴随出现感觉统合失调、睡眠障碍、异食癖、癫痫发作、肠胃功能障碍等并发症，为了减少这些并发症对儿童日常生活的影响，可以通过一些针对性的药物进行一些调整。除了改善自伤、易激惹和攻击行为的利培酮，还有用于改善注意缺陷与多动症状的中枢神经兴奋药物、用于癫痫发作者的抗癫痫药物等。
最近，中医疗法、饮食疗法等也逐渐受到家长的关注，在这里也进行较为简略的介绍。中医认为自闭谱系障碍病位在脑，同心、肝、肾三脏有密切联系
，认为先天不足、肾精亏虚、神失所养、心窍不通，肝失条达、升发不利是自闭谱系障碍的主要病机；在治疗方面，主要有中药治疗、针刺治疗等治疗手段。也有一些治疗报告在提高自闭谱系障儿童的认知及语言功能方面取得一定的疗效
，但需要配合科学的行为干预等，才可能从整体上改善儿童的临床效果。此外，也有学者认为由于中药相对于西药有较小的副作用，所以提出可以交替服用促进发育、调理睡眠的中药辅助康复治疗。但中医疗法对于自闭谱系障碍的核心缺陷的治疗作用还需要更进一步的检测和研究。
目前尚未有报告提出哪种食物对于自闭谱系障碍的康复有较为明显的效果，但值得家长注意的是，通常自闭谱系障碍儿童伴有挑食、偏食的情况，家长需要注重饮食的调整以便儿童能够有更为均衡、全面的营养摄入。
专栏1-7
自闭谱系障碍儿童可能需要的医学帮助
我们知道自闭谱系障碍不仅影响大脑和行为，还影响整个身体。因此，自闭谱系障碍儿童普遍可能会遇到的医疗问题主要包括睡眠障碍，比如入睡困难和频繁惊醒；饮食障碍，比如挑食和厌食；肠胃问题，比如便秘和腹泻；还有癫痫。不太常见的医疗问题包括极少的先天性的新陈代谢问题。医生应将检测新陈代谢条件作为病情检查的一部分。
睡眠障碍
睡眠问题在自闭谱系障碍儿童中非常普遍。事实上，据估计超过一半的儿童有至少一种频繁发生的睡眠问题。这意味着超过一半的自闭谱系障碍儿童父母有睡眠困扰。父母报告的睡眠问题主要有入睡推迟、梦游、早醒、阻塞性睡眠呼吸暂停（睡觉时呼吸沉重）和睡眠需要减少。
研究已显示儿童的睡眠困扰（包括自闭谱系障碍儿童）与注意不良、记忆困难以及行为问题（比如易怒和攻击行为）相关。自闭谱系障碍儿童父母报告的儿童睡眠问题中最普遍的是失眠。
如果儿童有睡眠问题，家长可以这样做：
（1）可以从温度、亮度、床垫、毯子的质地等方面为儿童提供舒适的睡觉环境。
（2）提供一个相对黑暗的睡觉环境，因为即使很弱的亮光也会影响N-乙酰-5-甲氧基色胺的分泌（如果需要的话一盏夜灯是可以的）。
（3）形成一个固定的睡觉时间表，包括定时打盹、睡觉和醒来。一般来说，在平时和周末就寝时间和睡醒时间也不应相差超过一小时。
（4）细心地计划就寝活动能帮助儿童在睡前冷静下来，因为自闭谱系障碍儿童容易过激。在睡觉前避免新的和意外的活动、过度的噪音、过度活跃的游戏和大量的食物。洗澡、唱首摇篮曲、拿出熟悉的玩具或毯子以及一起看书等，这些通常都能让儿童冷静下来。另外一些让其冷静的活动包括轻轻按摩、梳头和听轻音乐。
（5）儿童房里不要有电视，不要通过放电影、电视的方式来帮助儿童入睡。
（6）如果儿童有睡眠困难，家长还是需要带儿童去咨询专业医生，同时结合行为干预来帮助儿童。
肠胃问题和饮食问题
自闭谱系障碍儿童父母经常报告他们的儿童腹痛、腹泻、胀气和便秘。父母们报告得最普遍的是腹泻和便秘，这两种症状在儿童身上轮流出现。尽管这些问题在所有儿童中都非常普遍，也有证据表明它们在自闭谱系障碍儿童身上出现得更频繁。这些肠胃问题引起疼痛和不舒服，比如睡眠问题，会导致儿童的问题行为和注意困难，这些问题行为和注意困难又会导致儿童难以在干预项目中完全获益。
由于自闭谱系障碍儿童有沟通障碍，因此很难知道儿童是否正在经历腹痛或其他疼痛。要留意儿童的突发改变的行为，大哭或悲鸣、自伤行为、捂住胃，以及其他非言语的疼痛指示。如果家长对此怀疑，应将其带到医院就诊。肠胃问题是可治疗的。依据肠胃问题的种类和严重程度，治疗主要包括干预饮食、补充营养和药物治疗。尽管目前没有科学研究证明特殊饮食（包括消除酪蛋白和谷蛋白）能改善自闭谱系障碍儿童的行为，但有些家长已经报道这些饮食对他们有非常大的帮助，包括提高注意力，减少问题行为。
饮食问题在自闭谱系障碍儿童中也很普遍。最近一篇发表在美国儿科协会杂志上的研究发现自闭谱系障碍儿童通常在婴儿期就开始有饮食障碍。举例来说，他们在日后比典型发展儿童更早开始吃固体食物。1岁的时候，自闭谱系障碍儿童更可能被描述为“难喂养”和“很挑剔”。幼儿期，自闭谱系障碍儿童吃的食物种类很少。尽管就营养而言，这篇文章没有发现自闭谱系障碍儿童和典型发展儿童间的差异，但其他研究已经发现自闭谱系障碍儿童有时会营养不良，这也许是因为他们挑食或有特殊的饮食习惯。
如果儿童有肠胃和饮食问题，家长可以这样做：
（1）观察儿童的行为和饮食习惯；
（2）咨询营养师，帮助儿童吃得更好或者确保儿童获得必需的营养；
（3）结合行为干预帮助儿童形成科学规律的饮食习惯，包括定时吃饭、饮食的一些规范等。
癫痫
尽管癫痫在儿童生命的早期也会间或发生，但第一次发作通常是在自闭谱系障碍儿童青少年时期甚至是成年时期。几乎每四个自闭谱系障碍儿童中就有一个会在人生的某些时候遭遇癫痫。进行癫痫治疗非常重要，因为癫痫活动会影响大脑的功能和发展。因此，如果儿童有癫痫或癫痫活动的某些症状（频率很低），应尽快寻求医生的帮助。
癫痫的种类很多：有的癫痫发作时两眼发直且嘴中念念有词（称为失神性癫痫）；有的癫痫发作时身体做重复运动（称为复杂性部分发作癫痫）；还有的癫痫发作时身体抽搐（称为大发作癫痫）。轻微的癫痫症状很难被发现，因为有些症状比如双眼盯着某处，叫他没有反应等也是自闭谱系障碍的典型症状。失神性癫痫的症状可能包括“走神”或有10～20秒的时间对听觉视觉刺激没有反应、重复性地眨眼、眼睛上翻、嘴巴乱动、肌肉僵硬、身体剧烈运动、使劲搓手、两眼发直且嘴中念念有词。如果家长关注到这些可能发生的癫痫活动，请带儿童咨询儿科神经专家，对其进行检查评估。