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中医学应用五行学说，用事物属性的五行归类方法和五行生、克、乘、侮规律，具体地解释了人体的生理病理现象，并指导着临床诊断和治疗。
（一）密切关联——说明脏腑的生理功能及其相互关系
1.反映人体组织结构的分属 中医学在五行配五脏的基础上，又根据脏腑组织的性能、特点，将人体的组织结构分属于五行，以五脏（心、肝、脾、肺、肾）为中心，以六腑（实际上是五腑：胆、小肠、胃、大肠、膀胱）为配合，支配五体（筋、脉、肉、皮毛、骨），开窍于五官（目、舌、口、鼻、耳），外荣于体表组织（爪、面、唇、毛、发）等，形成了以五脏为中心的脏腑组织的结构系统，从而为藏象学说奠定了理论基础。
2.反映内外环境的统一 事物属性的五行归类，除了将人体的脏腑组织结构分别属于五行外，同时也将自然界的有关事物和现象进行了归属。例如，人体的五脏、六腑、五体、五官等，反应自然界的五方、五季、五味、五色等。这样就把人与自然环境统一起来。这种归类方法，不仅说明了人体与外界的协调统一。如春应东方，风气主令，故气候温和，气主生发，万物滋生。人体肝气与之相应，肝气旺于春。所以说“随天之五气，地之五行，人之五脏，而应象者也”（《素问直解》）。这样就将人体肝系统和自然春木之气一起来，从而反映出人体内外环境统一的整体观念。
3.说明脏腑的生理功能 五行学说，将人体的内脏分别归属于五行，以五行的特性来说明五脏的生理功能。木性曲直，条顺畅达，有生发的特性，故肝喜条而恶抑郁，有疏泄的功能。火性温热，其性炎上，心属上，故心阳有温煦之功。土性敦厚，有生化万物的特性，脾属土，脾有消化水谷，运送精微，营养五脏、六脏、四肢百骸之功，为气血生化之源。金性清肃，收敛，肺属金，故肺具清肃之性，肺气有肃降之能。水性润下，有寒润、下行、闭藏的特性，肾属水，故肾主闭藏，有藏精、主水等功能。
（二）过则有变——说明脏腑病理变化及其传变规律
由于人体是一个有机整体，内脏之间又是相互资生、相互制约的，因而在病理情况下，脏腑之间是相互影响、相互传变的，其影响和传变规律，一般都用五行学说的生克乘侮规律来加以说明。
五脏在生理上相互联系，在病理上也必然相互影响，本脏之病可以传至他脏，他脏之病也可以传至本脏，这种病理上的相互影响称之为传变。从五行学说来说明五脏病变的传变，可以分为相生关系传变和相克关系传变。
1.相生关系传变包括母病及子和子病犯母两个方面。
（1）母病及子：又称母虚累子。系病邪从母脏传来，侵入属子的脏器，即先有母脏的症状，后有子脏的症状。如水不涵木，即肾阴虚不能滋养肝水。其临床表现，在肾，则为肾阴不足；多见耳鸣，腰酸膝软，遗精等；在肝，则为肝之阴血不足，多见眩晕消痩，乏力，肢体麻木，或手足蠕动，甚则震颜抽掣等。阴虚生内热，故亦现低热，颧红，五心烦热等症。肾属水，肝属木，水能生木，现水不生木，其病由肾及肝，由母传子。
（2）子病犯母：又称子盗母气。系病邪从子脏传来，侵入属母的脏器。即先有子脏的症状，后有母脏的症状。如心火亢盛而致则现心烦或狂躁谵语，口舌生疮，舌尖红赤疼痛等；肝火偏旺，则现烦躁易怒，头痛眩晕，面红目赤等。心属火，肝属木，木能生火，肝为母，心为子，其病由心及肝，由子传母，病情较重。
2.相克关系传变 包括“相乘”和“反侮”两个方面。
（1）相乘：是相克太过为病。如木旺乘土，又称木横克土。木旺乘土，即肝木克伐脾土。先有肝的症状，后有脾胃的症状。由于肝气横逆，疏泄太过，影响脾胃，导致消化功能紊乱。肝气横逆，则现眩晕头痛，烦躁易怒，胸闷胁痛等；及脾则表现为脘腹胀痛，厌食，大便溏泄或不调等脾虚之候；及胃则表现为纳呆，嗳气，吞酸，呕吐等胃失和降之征。由肝传脾，称为肝气犯脾；由肝传胃，称为肝气犯胃。木旺乘土，除了肝气横逆的证候外，往往是脾气虚弱和胃失和降的证候同时存在。肝属木，脾（胃）属土，木能克土，木气有余，相克太过，其病由肝传脾（胃）。病邪从相克方面传来，侵犯被克脏器。
（2）相侮：又称反侮，是反克为害。如木火刑金，由于肝火偏旺，影响肺气清肃，临床表现即有胸胁疼痛，口苦，烦躁易怒，脉弦数等肝火过旺之征，又有咳嗽，咳痰，甚或痰中带血等肺失清肃之候。肝病在先，肺病在后，肝属木，肺属金，金能克木，今肝木太过，反侮肺金，其病由肝传肺，病邪从被克脏器传来。