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在实际生产过程中，淡水小龙虾苗种的生产方式目前主要是土池育苗，具体形式有三种：一是利用专门的苗种繁殖池进行苗种繁殖生产，待虾苗完全离开母体后，取出虾苗投入成虾池进行养殖；二是直接在成虾池中进行苗种生产，虾苗完全脱离母体后捕出亲虾，留小虾在池中进行成虾养殖；三是针对已经养过虾的鱼池，养成成虾后捕捞成品虾时有意识地留部分成品虾在原池中作为亲虾，繁殖生产苗种后，捕出亲虾。无论采取何种方式繁殖苗种，均是采取自然交配、自然繁殖、产卵、孵化的方式，主要技术路线是：鱼池准备→亲虾的挑选→（抱卵亲虾的挑选）→运输→下池→人工配种→亲虾的强化培育（抱卵亲虾的养殖管理）→抱卵亲虾的检查→抱卵量的测定→抱卵亲虾的养殖管理→孵化情况检查→孵化率测定→抱仔量的测定→产仔后的亲虾捕捞→仔虾的养殖管理→虾苗种的捕捞→成虾养殖。
对于专池繁育淡水小龙虾苗种的苗种池，要求选择的面积一般在1～3亩（1亩≈667平方米），不宜过大，具体大小视生产规模而灵活掌握。池底的淤泥厚度小于10厘米，既有深水区，也有浅水区。根据淡水小龙虾的穴居习性，池中最好有自然的土堆，有利于亲虾掘穴交配、产卵。深水区的水深要达1米以上，池埂宽1.5米以上，不渗水，土质要求为黏土，淡水小龙虾打洞后洞口不会坍塌，有方便的进排水系统，交通便利。
选好苗种池后，首先要进行整修，抽干池水，加固池埂，清除多余的淤泥，人工开挖深水区的沟渠，建造浅水区及必要的土堆，为淡水小龙虾的穴居提供条件。安装好防逃设施，防逃材料可以用石棉瓦、硬塑料板、水泥瓦等，因地制宜，只要能起到防逃效果即可。在亲虾入池前15天，每亩用100千克左右生石灰对水全池泼洒消毒、清野，清除敌害生物及竞争生物，杀灭病原体，同时每亩施放300～500千克的腐熟有机物堆于四角用于培养水质，然后进水。进出水口要安装过滤设施，进出水口的过滤网的网目必须在60目以上，防止敌害生物、野杂鱼苗及鱼卵的进入。淡水小龙虾具有地盘性与相互残杀的习性，为了防止相互残杀，进水后必须向池中投放一定量供淡水小龙虾攀援、栖息、躲藏的隐蔽物。隐蔽物的种类可以是茶树枝、柳树根、大树叶、竹筒、黑PVC管等，原则上是取材方便，价格便宜，能起到隐蔽的效果。进水后要向池中移植一定量的水生植物，尤其在池四周必须有水生植物，最好是挺水植物。池埂上的杂草不必除去，可以起到固土、保护洞穴的作用。水生植物的面积不超过繁育池的1/2，移植水生植物时要注意其品种，有选择地进行移植，浮水植物、沉水植物、挺水植物三者均要兼顾，目前主要移植的水生植物有下列几种：水浮莲、水葫芦、槐叶萍、水芹菜、黄花水龙等浮水植物；芦苇、野茭白、慈菇、香蒲、藕等挺水植物；马来眼子菜、伊乐藻、金鱼藻、苦草、聚藻等沉水植物。必要时可在水底平铺少量的稻草、芦苇等植物的秸秆，有利于仔虾的蜕壳与躲藏。
淡水小龙虾的性成熟年龄在9月龄以上，体重一般为每尾25～30克，雌、雄虾极易区别，从外观就可以辨别出来。雄虾的螯足相对比较粗壮有力，棘突长而明显（也有的雌虾螯足比较发达），关键是在第5对步足后部雄虾有2对钙质化硬棒，而雌虾是软条状；雄虾的生殖孔开口在第5步足的基部，不明显，雌虾生殖孔开口于第3步足的基部，是一对明显的暗色圆孔。亲虾的选择既可在当年的8～9月份进行，也可在翌年的4～5月份进行，选择前要对亲虾（主要是雌虾）成熟情况进行抽查，尽可能选择性腺发育丰满、成熟度好、腹部饱满有肉的雌虾作为亲虾。
选择亲虾的标准如下：
（1）颜色暗红或黑红色，有光泽，体表光滑无附着物。
（2）个体大，体重都要在40克以上，雄性个体最好大于雌性个体。
（3）雌、雄性亲虾都要求附肢齐全、无损伤，体格健壮，活动能力强。
对于外购亲虾，必须摸清它的来源、原生存环境、捕捞方法、离水时间等，运输方法要得当，在运输过程中注意不要挤压，并一直保持潮湿，避免阳光直射，尽量缩短运输时间，一般不要超过4小时，最好是就近购买。到达塘边后，先洒水，后连同包装一起浸入池中1～2分钟，取出静放1～2分钟，反复2～3次后，让亲虾充分吸水，排出鳃中的空气，然后才把亲虾放入繁育池中。放养时多点放养，不可集中一点放养。亲虾的放养量控制在每亩100千克左右，雌雄亲虾配比以1.5:1为宜。
放养亲虾后，要保持良好的水质环境，定期加注新水，定期更换部分池水，有条件的可以采用微流水的方式保持水质清新。由于亲虾的性腺发育对动物性饲料的需求量较大，喂养的好坏直接影响到其怀卵量及产卵量、产苗量，因此，在亲虾的喂养过程中必须增加动物性、高营养性饲料的投入，一般每天投喂2次，上午一次，喂养量占全天喂养量的30%左右，傍晚一次，占全天喂养量的70%左右，全天总喂养量占存塘亲虾总质量的4%～5%，喂养量还应根据天气、摄食情况及时调整。饲料品种以新鲜的螺蚬蚌肉、小杂鱼、屠宰场的下脚料为主，适当搭配一些玉米、麸皮、小麦等植物性饲料。动物性饲料要切碎，对植物性饲料要浸泡，然后沿池塘四周撒喂。各个放养点适当多喂。
在亲虾培育过程中，除控制水质、加强投喂外，还必须加强管理，每天坚持巡塘数次，检查摄食、水质、交配、产卵、防逃设施等情况，及时捞出剩余的饵料，修补破损的防逃设施，确定加水或换水时间、数量，及时补充水草及活螺蛳。对交配与产卵情况必须了如指掌，做好塘口生产的各项记录。
由于亲虾的放养时间不同，在后期管理上也有一定的差别，若是6月底7月初放养的亲虾，在8月下旬就应开始用虾笼捕捞部分雄虾，并同时检查雌虾的抱卵情况，逐步把雄虾捕捞完毕，到了9月份当幼虾离开母体后，继续用虾笼捕捉雌虾，捕到有抱卵或抱仔的雌虾要放回池中继续饲养，同时加强对幼虾的培养管理，也可捕出幼虾进行高密度、单独培养或出售或放入成虾养殖池中。若是8～9月份放养的亲虾，必须考虑亲虾的越冬管理，确保其安全交配、产卵、孵化，安全越冬。
在整个越冬期间亲虾基本不摄食，消耗很大，因此越冬前必须加强投喂，增强亲虾的体质，为安全越冬储备必需的营养，提高越冬的成活率。当水温降至10℃以下，亲虾基本入洞穴越冬，很少出洞活动，此时应适当加深水位，保证洞中有水或潮湿，但水深不可超过洞口，比洞口略低，否则亲虾会出洞重新选择地方打洞。当亲虾基本入洞后，沿池塘四周水边铺一层薄薄的植物秸秆，如稻草、芦苇、香蒲等，一是为了保暖，二是为在亲虾越冬前产下的仔虾提供隐蔽、越冬的场所。
当水加满后，要施放肥料，保持水质的一定肥度，一般每亩施放腐熟有机肥100千克左右，堆于池塘四角或四周的水中。冬季水质由于受天气的影响极易变清，根据实际情况，必要时还需追施肥料，力保透明度在30厘米左右，原因是水肥不易结冰，水中的浮游生物会多，尤其到春天，浮游生物会很快大量繁殖，仔虾一出洞就容易得到营养丰富、大小适口的天然饵料，提高仔虾的成活率。
亲虾的洞穴有两种：一种是洞口有堆宝塔状泥土封住，这种洞穴俗称“封口洞”，虾在洞中一直到春季才会出洞；另一种洞口是开放式的，虾会在洞口洞底间游走，当天气晴好、气温升高时，虾会出洞，在洞口附近活动。越冬期间遇到天气晴好、气温回升时，中午时分要在开放式洞口附近适当投喂一定量的饵料，供出洞活动的淡水小龙虾摄食，这对提高越冬的成活率十分必要。坚持每天多次巡池，观察亲虾的活动情况，在寒冷天气要及时破冰，同时要做好各项记录工作，尤其是死亡情况，对雌雄虾的个数、大小和质量等必须统计清楚，这有利于以后的喂养及对苗种量的估算。
淡水小龙虾苗种的繁育目前主要有两种方式：一是工厂化人工繁殖；二是土池人工繁殖。
建立室内水泥池进行工厂化人工繁殖淡水小龙虾苗种，采用流水或充气结合定期换水的方法，为虾苗生长发育提供良好的环境，因此可以进行高密度育苗。可根据养殖生产所需苗种，定时提供充足的虾苗。
工厂化育苗设施主要有室内孵化池、育苗池、供水系统、供气系统及应急供电设备等。有条件的育苗厂也可建设室内亲虾暂养池及交配池等。繁殖池、育苗池的面积一般为12～20平方米，池水深1米左右。建有进排水系统及供气设施，进排水管道以塑料制品为好。繁殖池及育苗池的建设规模，应根据本单位生产规模及周边地区虾苗市场需求量而定。
工厂化育苗所用的亲虾可为池塘、湖泊或水库中采捕的抱卵虾，也可选用在秋季收集的亲虾经土池强化培育后自然交配产卵的抱卵亲虾。选择抱卵虾以受精卵颜色基本一致为宜，分批孵化，保证所孵出的幼体发育基本同步，从而确保出池虾苗的规格基本一致。
可直接把抱卵虾放入孵化池中，也可放入孵化池里的网箱中，网箱的网目大小应能让虾苗直接进入孵化池中。放养量为每平方米100只左右。抱卵虾孵出蚤状幼体，蚤状幼体吊挂于亲虾的腹部附肢上，蜕壳后成1期幼虾，幼虾全长在1厘米以内时通常由亲虾保护1周，因此要及时捕出产后的亲虾。幼虾分散于池的底层，营底栖生活，进行虾苗培育。也可让抱卵虾在繁殖池中集中孵化，然后将幼虾用网捕捞出后分散到育苗池中进行培育。将幼虾按每立方米水2万～3万尾移到育苗池中培养。收集幼虾时可用光、流水诱捕或排水网箱收集。在收集移苗过程中动作要快、轻，以防幼虾受伤影响发育及成活率。
孵化后的幼虾很快开始进食，此时即可投喂饵料。饵料主要为天然浮游动物和人工饵料。天然浮游动物主要为轮虫、小型枝角类及桡足类的无节幼体，投喂可分上、下午各一次；人工饵料主要为熟鱼、蚌肉浆及颗粒饵料等，每天投喂2～4次。投喂量应根据幼虾活动、摄食及发育情况等来确定。在亲虾护幼期间要适当投喂成虾料，要多换水，保持良好的水环境。在整个苗种繁育过程要求24小时连续充气增氧。
在育苗过程中要经常观察、定期检测水质情况，并做好生产记录，便于总结经验教训。
幼虾离开母体后，在水温20℃～25℃的水中经10天以上培育，待幼虾长到2厘米以上时即可起捕，再进行幼虾培育或直接进行成虾养殖。
淡水小龙虾土池繁育苗种成本低，可操作性强，是解决淡水小龙虾苗种来源的最佳途径。土池繁育苗种的主要任务是管理，根据淡水小龙虾个体繁殖量小、群体繁殖能力很强、整个群体分秋季和春季繁殖的特点，对苗种繁育期间的管理如下。
在秋季和春季，当水温达到18℃以上，亲虾会陆续出洞，出洞的雌虾大部分是抱仔虾，也有早期抱卵、孵化后的仔虾相继离开母体独立生活，也有部分仔虾只是在母体的周围活动，一旦受到惊吓就会吸附到母体上。此时所有的仔虾活动能力均较弱，如果不能及时得到充足、适口、营养丰富的饵料，就会影响到仔虾的蜕壳，甚至会因营养不足而导致大批死亡，因此此时的管理工作显得尤为重要。
当发现亲虾出洞后（洞口有新鲜泥土表示淡水小龙虾已经开始出洞），必须适当补充一些新鲜水或更换一部分池水，加水或换水量控制在10厘米左右，有条件的最好保持有微流水流动，力保水体中的溶氧能保证仔虾正常生长的需要。
为了保证仔虾离开母体后能及时得到充足、适口、营养丰富的天然饵料，必须适当进行追肥，每亩追施腐熟有机肥100千克左右，采用全池泼洒的方法，培养营养丰富的浮游生物等天然饵料，供仔虾利用。由于仔虾会陆续离开母体独立生活，数量越来越多，天然饵料无论从数量上还是营养方面都远远不能满足仔虾生长的需求，为了保证大批量仔虾生长营养的需求，此时必须投入营养价值较高的动物性人工饵料，如鱼糜。将鱼打成鱼糜或鱼浆，沿池四周进行泼洒喂养，每天2次，上午占日投喂总量的40%，傍晚占60%，日投喂量按每万尾虾100克鱼计。此时亲虾仍在池中，为了防止争食，在投喂鱼糜前必须先投喂一定量的亲虾料，可以是颗粒料、麸皮、麦子、玉米、切碎的鱼块或屠宰场下脚料等。日投喂量占亲虾总质量的3%～4%，让亲虾先行吃饱，减轻亲虾与仔虾争食的程度。
在加强水质管理、天然饵料的培养、人工饵料的投喂的同时，为了防止亲虾与仔虾争夺饵料和地盘，防止亲虾吞食仔虾的现象发生，有必要把雄亲虾、没有抱仔的雌亲虾及早期离开母体而已长成规格较大的幼虾分离出来，为仔虾生长营造一个良好的环境。具体方法是采取定置地笼捕捞，选择网眼相对较大但又不卡幼虾的地笼对亲虾进行捕捞，捕捞出的亲虾若有抱卵或抱仔的，应立即放入原池中进行继续饲养，其他的可以直接上市，也可放入暂养池中强化培育，让其恢复后作为亲虾再次使用或上市（对于亲虾目前只是使用2年，一般不提倡使用3年）。捕捞出的大规格幼虾可以直接放入成虾池中进行养殖，也可以出售，不宜放回原池。在捕捞亲虾及大规格幼虾的过程中，收起地笼后一定要先剔出抱仔虾和抱卵虾，不可使其受伤，然后再处理其他的虾。若感到仔虾的密度过大，可以适当加入一定量的密眼地笼，捕出部分仔虾单独进行培育或出售。
幼虾的蜕壳频率很高，蜕壳时，为了避免受到伤害，一般先选择一个隐蔽的地方让其静卧蜕壳，而此时仔虾的密度很大，水温又低，水草及其他一些水生植物刚发芽，未到生长旺盛期，提供给仔虾蜕壳隐蔽的地方相对较少。为了仔虾能顺利蜕壳，不受到同类的伤害，提高苗种的成活率，有必要向苗种池中投入一定量的已经消过毒的人工隐蔽物。人工隐蔽物的品种有毛竹筒、深色PVC管、易拉罐、瓦片、石棉瓦、柳树根、棕榈树皮、茶树枝和面积相对较大的枯树叶如意杨树叶、梧桐叶等，最价廉物美、最易取到、效果也较好的人工隐蔽物是柳树根、棕榈树皮、茶树枝、意杨树叶、梧桐叶，在池底铺设一定量的植物秸秆也能起到较好的效果。铺设好人工隐蔽物后，要密切注意水质的变化，一旦发现水质变坏（尤其是铺设植物秸秆的，水质变化很快），必须及时进行换水，始终保持一个良好的水质环境。
在投放亲虾前，应对池塘进行清洁和整修，清除多余的淤泥，修建防逃设施，清除池埂四周的杂草，这样有利于亲虾的掘穴、交配、产卵。进行必要的清野、消毒，杀灭敌害生物及疾病源，进水时要对水进行彻底过滤，防止敌害生物及竞争生物进入，进水后要种植或移植水生植物、浮水植物、沉水植物、挺水植物，水生植物总面积要占全池面积的2/3左右，同时还要增设一定量的人工隐蔽物。初次进水的深度要稍高，保持在1米以上，适当施放部分基肥，一般每亩施放腐熟有机肥200千克左右。
亲虾的投放要在晴天的早上进行，避免阳光直射，要注意分散、多点投放，不可集中于一点放养。投放外购亲虾前必须让亲虾充分汲水后方可投放。亩投放亲虾量控制在30千克以下，雌雄比为（1.5:1）～（2:1），也可直接投放抱卵亲虾，亩投放量控制在20千克左右，适当搭配5%数量的雄虾，防止抱卵虾经过搬动后受精卵脱落，放养雄虾可以再次交配、产卵。也有在前一年养殖的基础之上有意识地留下部分成虾不捕，作为亲虾在池中饲养后繁育苗种，关键是留下的量要估算准确。在通常情况下，规格为25～30尾/千克的一只淡水小龙虾可产受精卵150～300粒，在土池中孵化率一般为40%～60%。因此，一只淡水小龙虾能产幼虾60～100尾，养殖产量200～300千克/亩的苗种放养量为15000～20000尾/亩。在推算留塘亲虾时，可以用以下公式计算：
亩放亲虾质量=（20000×2）÷（60×25）=26.67（千克）
投放亲虾后，必须加强动物性饲料的投喂，保证亲虾繁殖的营养需求。经过7～10天精心饲养，亲虾会逐步掘穴交配产卵，一旦大部分亲虾进洞后，可慢速排出部分池水，水深控制在60厘米左右。在加强投喂的同时，要经常检查亲虾的抱卵情况，做到心中有数，并适时追肥培育水质，使早期繁殖后离开母体的仔虾能及时、充分得到适口的、营养丰富的天然饵料。当发现亲虾大量抱卵或有一定量的仔虾时，要及时捕出雄亲虾及产过苗的雌亲虾，尽量减少存塘量，为抱卵虾的受精卵孵化及离开母体的仔虾生长提供一个良好的环境。
至11月份气温逐步降低，大量的亲虾及大规格的幼虾已陆续进洞，有的洞口甚至已经用泥土封死（整个越冬期间是不打开的），此时应逐步把池水加深，直到加至比淡水小龙虾的洞口稍低的部位，力保淡水小龙虾洞中有一定的水位或相对较潮湿。冬季气温高时仍有部分淡水小龙虾出洞，在洞口附近活动，可适当投喂一定量的饵料供其食用，日投喂量可视摄食情况、天气状况、气温的高低灵活掌握，并及时调整。通常在天气晴好、气温高时的下午投喂，投喂地点选在四周（中间土堆的四周）洞穴较多的地方。
在冬季，水生植物已基本枯萎死亡，为了让离开母体又不能掘穴的仔虾有隐蔽场所，能安全越冬，有必要在池塘四周水边铺设一定量的植物秸秆，如稻草、麦秆、芦荟、香蒲等，往池中投放一定量的茶树枝、意杨树（或梧桐）叶、柳树根、棕榈皮等仔虾喜欢去隐蔽的人工材料。投放量根据仔虾量而定，但总面积一般不超过池面积的1/2。
在春季当水温回升到10℃以上并相对稳定时，就会有淡水小龙虾离开洞穴出来活动，此时越冬后的幼虾也已开始摄食，为了保证淡水小龙虾能安全快速生长，必须提供足够的营养。由于经过一个长长的越冬期，无论是抱仔亲虾，还是离开母体的仔虾及幼虾，体质均十分虚弱，必须摄取大量的食物来恢复体质，因此在这段时间淡水小龙虾摄食相对较为旺盛，尤其对动物性饲料的需求量较大，投喂时必须增加动物性饲料（如鱼糜、螺、蚬、蚌肉、屠宰场下脚料等）投喂比例。为了保持营养均衡，植物性饲料（如豆浆、麸皮、小麦、玉米、菜饼等）也是必不可少的，喂养同时要考虑到大小虾仍处于一个池，为了防止争食，必须先投喂颗粒状大的虾料，让大虾先行吃饱后再投喂仔虾及幼虾料。
开春后另外一项重要的工作，是经常检查仔虾离开母体的情况。一旦发现有部分仔虾离开母体，必须做好产后亲虾的捕捞工作。在捕捞亲虾的同时，根据捕获的雌亲虾数量，测算出存塘仔虾的数量，通常按每只雌亲虾产200～250只仔虾测算。若在捕亲虾时发现仔虾及幼虾数量过多（超过计划放养量），可以在捕亲虾的同时捕出多余的仔虾和幼虾单独培养或出售，既可以创造一定的收入，又可以减轻存塘的压力，不至于影响整体稚仔及幼虾的生长，更不至于影响对成虾的饲养、管理。