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1978年，为了筹备高等学校科学研究工作会议，国家科委和教育部联合组成调查组，从9月份开始，分别到北京、大连、长春、上海、南京、武汉、广州、西安、成都、昆明等地，调研了解高等学校科学研究工作的情况。
在时任国家科委常务副主任蒋南翔的带领下，10月7～12日，联合调查组来到昆明，对云南大学、昆明工学院及中国科学院下属的云南天文台、昆明动物研究所、昆明植物研究所进行了调研。其间，蒋南翔同志还同时任中共云南省委书记的安平生同志就进一步办好云南大学交换了意见。
在充分调研的基础上，联合调查组形成了《需要办好云南大学，为西南边疆的建设发挥更大的作用》的专题调研报告，并于1978年10月30日以《高等学校科学研究工作会议筹备工作简报》（第1期）的形式，上报给时任中共中央副主席的邓小平同志，国务院副总理方毅同志、聂荣臻同志，以及国家计委、财政部、物资总局、农业部、中国科学院和国家科委党组与教育部党组。
该报告首先指出：“云南大学是在一九二二年，军阀唐继尧统治云南时创办的，已经有五十多年历史，是云南地区基础最好的一所学校。今年，教育部已将云南大学列为全国重点学校。大家认为，进一步办好这所学校，使它成为西南边疆的教育中心和科学中心，很有必要。”为什么这样讲？第一，“云南地处西南边疆，同缅甸、泰国毗连，在这里就地办好一所重点学校，促进边疆地区的四个现代化，政治意义很大”。第二，云南具有得天独厚的地理环境，素有“植物王国”“动物王国”和“有色金属王国”之称，并拥有丰富的褐煤资源、水利资源和开展天文学及宇宙射线研究的极好条件，“所以，为发展云南的科学、教育事业，在西南边疆建设起先进的教育中心和科学中心，以促进云南资源的开发和工业、农业的现代化，云南大学是大有可为的”。第三，“云南目前教育事业比较落后，科技力量十分薄弱，更增加了进一步办好云南大学的紧迫性”。报告列举了一系列数据：全省工程技术人员号称有3.5万人，但工程师、技师只占4.5%；农林方面，全省没有一个总农艺师，平均三个县才有一个农业技师；全省专业科研机构中高级研究人员只有45人，占这些单位科研人员总数的0.6%；中学师资缺乏，一部分学校开不出数理化课。1978年大学招生，全省10.8万人报考，300分以上的只有1800多人，仅占约1%。基于这种情况，报告强调：“看来，要有效地充实和提高云南的科技教育队伍，非办好本省的教育不可，特别是非办好本省的高等学校不可。”
该报告接着分析了办好云南大学的有利条件和存在的困难。关于进一步办好云南大学的有利条件，表现在三个方面：一是有多年积累形成的一支教师队伍，一批有专长的老专家，科学研究方面有一定基础。二是中国科学院根据云南的资源条件和自然环境，拟议在云南建立生物、天文、宇宙线三个研究中心，如果搞好学校同科研机构的合作，两者的学术水平都可以提高得更快。三是云南大学当时的领导班子中，主要负责人熟悉教育、热心科学，领导力量还比较强。关于存在的困难，该报告认为：“同其他重点学校相比，云南大学的困难相当多。”主要有：一是学校的教学科研设备极差，如化学系连光谱仪都没有。有的美籍学者参观了云大生物系，说这个系的设备还不如美国普通中学的实验室。二是教师队伍不稳。由于设备条件不允许开展科学研究，教师队伍很不安定。大家羡慕中国科学院的设备、条件，“人心思院”。三是云南大学的教师数量很少。理科各系总共只有三百八十几人（复旦大学、南京大学理科教师都在一千人上下）。教师之少，在重点大学中是仅有的。
该报告最后强调：过去，领导对这所学校的帮助也不够，要较快地办好云南大学，需要省委和教育部加强领导，要解决好以下几个问题。
第一，确定重点。“要把云南大学作为云南地区科技事业和教育事业的结合点，下决心在五年之内办好它。要集中力量抓这所重点学校；不要再分散力量，不然哪个也抓不上去”。第二，确定方向。“根据云南的自然环境和资源条件，配合科学院的规划，云南大学可以生物、天文、高能物理作为重点，围绕这个方向适当调整全校的系和专业的设置”。第三，加强协作。主要是搞好云南大学同当地科研单位的协作，互相支援，互通有无，发挥现有科研力量和设备的效用，使学校和科研单位的水平都能更快地上去；还要壮大教师队伍，避免教师继续外流。第四，给予支持。“教育部和国家科委应当在经费、基建、设备更新和安排教师参与学术活动、出国进修、参加国外专家来华讲学班的学习等方面给予更多的支持和照顾。”
该报告特别指出：“这样，云南大学就有希望成为一所独具特色的全国重点大学，为西南边疆的四个现代化发挥更大的作用。”
1978年，中国改革开放的帷幕正在徐徐拉开，改革开放呼唤教育兴国、科技兴国。联合调查组从形势发展的需要出发，提出“办好云南大学，为西南边疆的建设发挥更大的作用”这一时代课题，并明确指出要将云南大学建设成为“西南边疆的教育中心和科学中心”，给云南大学的未来发展做了清晰的定位。这体现了时代发展的要求，也体现了党和国家对云南大学的关心与期望。该报告客观分析了进一步办好云南大学的有利条件和面临的困难，强调要重视云南大学的建设与发展，这是基于历史发展和现实需要所得出的准确结论。联合调查组提出的较快办好云南大学需要解决好的四个方面的问题，既具有针对性，又具有预见性，对今天办好云南大学仍具有重要启示和现实指导作用。