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成员关系灵活、集成创新性强、不确定性程度高是创新团队的本质特征，为了构建适用于创新团队管理的一般性理论以及评价方法，本书在界定创新团队内涵、特征以及类型的基础上，分析不同类型创新团队在组织结构、团队关系以及管理方式等方面的差异性，并针对其差异性给出不同类型创新团队不同效率的内涵界定以及评价方法。为有效解决创新团队管理效率评价问题，在充分考虑创新团队存在成员关系灵活、集成创新性强以及不确定性程度高等独特属性，通过对不同类型的创新团队进行分类辨析，并针对不同类型创新团队的管理效率差异给出特定效率内涵界定、研究视角以及相应的评价方法，以期从整体性上给出一套针对不同类型创新团队的差异化效率评价的理论与方法，并通过云南中烟某公司创新团队进行案例应用以验证论文所提方法的可行性，并针对存在的不足之处给出具体的优化策略。
为实现该目的，本书开展相关研究主要解决以下三方面问题。
创新团队因其成员多样性、关系灵活性、不确定性程度高等特征使其呈现出不同的组织结构类型，例如，企业创新团队与高校创新团队因其主要目标、科研平台、合作方式等方面的不同而使其组织结构具有较大的差异性，这就需要采取不同的管理方式对其进行科学管理。鉴于此，如何在深度把握创新团队固有属性的前提下系统分析创新团队内部的典型特征，针对不同类型的创新团队分析其组织结构、管理模式以及效率评价的侧重点，在此基础上给出具体的内涵界定、基本构成以及作用关联，是本书研究的第一个难点。
通过对国内外相关数据进行系统化梳理发现，虽然国家在政策引导、经费支持、平台打造等方面提供了大量的支持性扶助政策，目前我国科研成果数目已经跃居世界第二，但是在创新团队建设过程中亦涌现了大量富有中国特色的问题。例如，团队组建动机不纯、拉帮结派、近亲繁殖等问题，由此导致团队管理难度较大，这些问题多属于个体内部现实问题，并不能通过显性化的制度规范予以有效解决，更多地依靠成员个体自我约束、自我规范。此外，这些问题的存在也可能会影响其他成员的积极性以及创新动力，甚至影响整个团队的发展。为此，通过对管理效率的评价，改善传统定性化的绩效考评体制，通过对科研成果进行分层次奖励，拉开高水平科研成果与一般科研成果的奖励差距，激励创新团队成员产出高水平科研成果，打破个体研究局限，实现团队整体协同攻关。鉴于此，如何借助管理效率的评价改善创新团队管理质效，解决团队管理的复杂难题，为提升创新团队管理效率给出具体的评价方法，丰富创新团队管理效率的研究思路，是本书研究的第二个难点。
创新团队因涉及不同领域、不同行业、不同企业而具有多样化的组织形式，且创新团队主体多样性、能力差异性、环境不确定性等因素对管理效率的影响程度比较难以定量化，这使得大多数管理效率的评价方法多侧重实际产出绩效方面而忽视团队合作过程、多注重产出数量而忽视高水平科研成果产出的时限性要求，由此出现明显的学术功利性行为，具体表现在，学术成果多但实际贡献有限，沦为学术垃圾。如何通过创新团队管理效率的评价营造团队和谐的管理氛围，促使团队合作以集成多方智力资源共同产出高水平科研成果，是本书拟解决的关键问题。但受限于当前关于创新团队管理效率评价的相关有价值性的参考文献极其匮乏，如何构建创新团队管理效率的评价标准及可行性方法，为创新团队管理效率的标准定量化及方法的相对普适性提供一套系统的评价方案，是本书研究的第三个难点。
从基础研究发展规律和趋势看，科学领域在不断分化的同时，又不断走向综合。效率研究更多集中在宏观经济、产业经济和区域经济的研究中，面向管理效率的研究无论从系统性还是从可操作性来看，都存在较大基础理论缺口。这种情景下，考虑到在各门学科之间，正在不断发生研究方法与知识体系的交融，并由此产生了新的科学前沿和新兴学科，因此本书聚焦于创新团队的管理效率研究将形成关联学科的交叉创新，不仅将形成新的效率解析维度、内涵和评价方法，也会形成新的管理效率评价与解读策略，对于借助经济效率分析原理有效提升微观管理效率具有重要意义。
科研组织模式历来需要与科研的对象相适应。当代科技发展日新月异，科学问题之间的相互联系不断增多，科学研究对象的复杂性不断增强。如果在科研模式上只强调单兵突进，就无法实现系统深入，就会影响对复杂对象的重大突破，影响对科学规律整体认识的深化。因此对一些复杂科学问题，需要组成团队，凝聚不同学科背景、不同学术视野、不同专业见解的科研人员集体攻关。具有不同学科背景，围绕共同研究目标组成的科研团队，跨学科、跨领域、跨地域，甚至全球化的科学家密切合作，对促进基础研究发展、推进自主创新具有十分重要的意义。
创新团队虽然受到国家及地区各级政府在政策、经费、平台等方面的大力支持，经费逐年增加、人才规模持续扩大，但相关科研成果对社会的实际贡献较为有限。而创新团队作为国家推进“科教兴国”和“人才强国”战略的重要力量，通过对创新团队内部复杂的管理难题进行系统化剖析，明晰影响创新团队持续发展与成果有效转化的关键要素，可以对不同类型创新团队管理效率进行评价，进而改善绩效评价方法，有针对性解决阻碍创新团队发展的顽疾。
创新团队成员因知识能力结构、角色行为感知、资源利用效率等方面的差异而导致不同成员间、成员与领导间以及内外部合作主体间存在着时间、空间等方面的合作与沟通交流障碍，导致同等资源、经费支持条件下科研成果的产出质量与效率具有显著的差异性。通过分类辨析不同组织结构类型创新团队管理效率的内涵与评价方法的差异，对创新团队管理效率影响因素进行分析的基础上，给出不同类型创新团队管理效率的具体内涵与针对性评价方法，可以提升创新团队管理效率和团队的合作质效，促进组织间知识共享的持续推进与科研成果的有效转化，为科教兴国战略和建设创新型国家做出应有的贡献。