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机体摘除性腺，对其并不致命，但丧失了生育能力，可知性腺为繁育后代的根本。在藏象学说中，将性腺归于肾系，认为肾主生殖，实际上是指性腺的功能，当然亦与肾脏、肾上腺有着不可分割的关系。
性腺主持生殖、生长与发育，具有造化之机，为性命之根蒂。其生理功能又受全身发育状况的影响，其中主要是肾气的作用。性腺的生理节律有着“七女八男”的自然规律（见前），其调节模式是：肾气盛→天癸至→性腺发育→精气溢泻（男排精）；月事以时下（女排卵）→阴阳和合→受精孕育胚胎。
天癸是肾中精气充盛到一定程度时机体就会产生的物质，具有促使性器官发育成熟的作用。从现代医学看，应是指促性腺激素——卵泡刺激素（FSH）和黄体生成素（LH），且男女尽管有别亦俱称天癸，似与现代认识的男女促性腺激素的一致性有着不谋而合之感。而促性腺激素释放激素（GnRH）的生成是否与肾上腺功能状态相关呢？如兴奋下丘脑促性腺激素释放神经元的递质是单胺神经递质，这与肾上腺髓质相关；孕激素是许多类固醇激素（性激素和肾上腺皮质激素）生物合成中的重要中间体，说明肾上腺皮质与生育密切相关。而这些也是命门“男子以藏精，女子以系胞”的功能体现。
性腺亦同样具有肾系的功能，参与主骨生髓，通于脑等功能。
再从男女有别看，性腺不仅与生理活动有关，更重要的还与人的心理相连接，塑造了相对的性情，造化出丰富多彩的人生精神世界。