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六腑的功能是受盛和传化水谷，实而不能满。饮食物自进入人体至排出体外，要通过七道关隘，以利于对饮食的消化吸收，这七道关隘即所称之“七冲门”：“七冲门何在？唇为飞门，齿为户门，会厌为吸门，胃为贲门，太仓——口为幽门，大肠小肠会为阑门，下极为魄门，故曰七冲门也。”当然腑不是传化水谷，但其共同生理特点都是：以降为顺，以通为用，先贮（藏）而排（泄）。
胆与肝相连，附于肝之短叶间，胆又为奇恒之府。
（一）贮存和排泄胆汁
胆囊内藏清净之液，即胆汁。胆汁色黄绿，味苦，是“肝之余气泄于胆”而形成的，即由肝脏分泌储藏于胆。胆汁泄于小肠，有助于对饮食的消化，是脾胃消化吸收功能得以正常进行的重要条件，这主要是促进脂肪的乳化和吸收。胆汁的化生和排泄，是由肝的疏泄功能来控制和调节的。
（二）主决断
胆为中正之官，主决断，具有不偏不倚的特性
胃，又称胃脘，分上、中、下三部。胃的上部称为上脘，包括贲门；胃的中部称中脘，即胃体的部位；胃的下部称下脘，包括幽门。
（一）主受纳、腐熟水谷
受纳，为接受和客纳水谷。腐熟，是饮食物在胃中经过初步消化，形成食糜的意思。
（二）主通降、以降为和
食糜必须下行入小肠，进一步消化吸收。胃的通降也是继续受纳的前提条件。胃的通降还包括小肠、大肠的传导功能。
上述两点都是胃气的功能表现。胃气之盛衰有无，关系到人体的生命活动及其存亡。胃气，主要是指胃的舒缩功能，主要与Ach能系统的关系最为密切，Ach能系统及其调控的功能是胃气健旺与否的标志，或可谓胃气统括了迷走神经的功能。因生命在于运动，运动是生命力体现，所以胃气是为生命之本。而中气具有升举偏温的特性，兴许是指chE活性。
（三）促进血液化生
“中焦受气取汁，变化而亦，是谓血。”脾胃为气血生化之源，胃处中焦，说明胃与血液化生密切相关。从现代医学看，在正常胃组织和胃液中，存在着一种与维生素B 12 吸收有关的“内因子”，缺乏此因子，就会产生恶性贫血。内因子是由胃腺的壁细胞分泌的一种糖蛋白，分子量约为6万。内因子在胃内能和食入的维生素B 12 结合在一起，形成一个不透析的复合物，移行至回肠，附着在回肠黏膜的特殊受体上，有促进回肠上皮吸收维生素B 12 的作用。
小肠，是一个相当长的曲转的管道器官，位于腹中，其上口在幽门处与胃之下口相连，其下口在阑门处与大肠之上口相连。
（一）主受盛和化物
“小肠者，受盛之官，化物出焉。”小肠是接受经胃初步消化的饮食的盛器，食糜在小肠内经过进一步消化，才能把水谷化为精微而被吸收，食物残渣则出此下输大肠。
（二）泌别清浊
经消化的饮食物，在小肠部位，吸收精微物质，排除浊物，这也是脾胃升清降浊功能的具体表现。
（三）主液
“小肠主液”，主指小肠对脂溶性物质的吸收与调节，亦即脂溶性物质主要在小肠被吸收，下入大肠就不被吸收了。
大肠亦居腹中，其上口在阑门处紧接小肠，其下端紧接肛门。其间又分升结肠、横结肠、降结肠、直肠，阑尾也归属大肠。
（一）主传化糟粕
“大肠者，传导之官，变化出焉。”大肠将食物残渣糟粕形成粪便，排出体外。
（二）主津
“大肠主津”，指大肠能再吸收糟粕中多余的水分，主持对水分（部分水溶性物质、电解质）的吸收与调节。
膀胱位于小腹中央，为储尿器官，其上有输尿管与肾脏相通，其下出为尿道。其生理功能是储尿和排尿。尿液在肾的汽化下生成并输入膀胱，当尿液储存到一定程度，又通过肾的汽化作用及时排出体外。称尿液为津液，可理解为强调尿液仍有重新利用的价值。
三焦是上焦、中焦、下焦的合称。其部位在胸腹腔内。而其形态，由于三焦的某些具体概念不够明确，因此引起了后世的争论。
《难经》认为三焦“有名而无形”。
认为有形的代表是张景岳，《类经》：“盖即脏腑之外，躯体之内，包罗诸脏，一腔之大府也。”称三焦为“孤府”。《类经附翼》：“今夫人之一身，外自皮毛，内至脏腑，无巨无名，无细无目，其于腔腹周围，上下全体，状若大囊者，果何物耶？且其着内一层，形色最赤，象如六合，总护诸阳，是非三焦而何？”从现代医学看，可认为受内脏神经支配的胸腹腔外包膜即是三焦，则能兼容两种观点之妙，因胸腹膜脏层亦为构成诸脏腑的外膜。
（一）主持诸气
人体之气，特别是最根本的原气，是通过三焦布散至五脏六腑，充沛于全身。三焦是气的升降出入的通道，又是汽化的场所，故有主持诸气，总司全身气和气化的功能。如今看来，在外周肾、肠系膜等血管存在有DA受体，可能主要与三焦系相关，且不仅仅如此。
（二）外应腠理
三焦将元气布于腠理，主管纹理。腠理具有致密的特性，现代主要是指（皮肤）黏膜层，黏膜层（微血管）应有DA受体存在。所说的“肾合三焦”，主要是指肾上腺与三焦相通应，肾上腺髓质产CA，皮质产皮质激素等，均具有固密的功能。
（三）通行水液
三焦是水液的通路，有疏通水道、运行水液的功能。这可认为三焦具有疏通透析的作用。
（四）三焦的分部与兼能
三焦是脏腑之外膜，其基因表达嵌入各脏腑器官的部分功能，同时兼有分部的功用。
1.上焦如雾：一般将膈以上的胸部，包括心、肺两脏等称上焦。上焦的功能主要是宣发卫气，布散水谷精微以营养全身。《营卫生会》将其形象地描述为“上焦如雾”。
2.中焦如沤：“中焦亦并胃中”，所指是胃脘部。现一般认为中焦是指膈以下，脐以上的部分。中焦有参与消化、吸收和输布水谷精微并化生血液的功能。
3.下焦如渎：现一般以脐以下的部位为下焦，包括脐以下的腹部、阴部以及小肠、大肠、肾、膀胱、肝脏等脏腑。后世对藏象学说有了发展，将肝肾精血、命门元气等都归属于下焦，因而扩大了下焦的生理功能特点。