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《灵枢·经脉》曰：“肺手太阴之脉，起于中焦，下络大肠，还循胃口，上膈属肺。从肺系，横出腋下，下循臑内……”“肾足少阴之脉，起于小指之下……其直者，从肾上贯肝膈，入肺中，循喉咙，挟舌本。”说明肺肾两脏通过经络相连。《十四经发挥·卷中》又有云：“督脉者，起于下极之俞……并于脊里，上至风府，入脑上巅循额至鼻柱，属阳脉之海。”而肺开窍于鼻，故肺肾两脏亦通过鼻部相联系。
肺主呼气，肾主纳气，肺肾配合，共同完成呼吸运动。可见，肺肾两脏在维持、调节机体的正常呼吸运动中起着重要的作用。
肺呼吸的深度需要肾气的摄纳潜藏来维持，肾气充盛，吸入之气方能经肺之肃降而下纳于肾。《医学入门·脏腑条分》曰：肾“纳气收血化精，而为封藏之本。”《医宗必读·肾为先天本脾为后天本论》则认为：“肾为脏腑之本，十二脉之本，呼吸之本。”清代医家林佩琴也在《类证治裁·喘症论治》提出：“肺为气之主，肾为气之根；肺主出气，肾主纳气。阴阳相交，呼吸乃和。”另一方面，肺气肃降，有利于肾之纳气，而肾气摄纳，也有利于肺之肃降。若肾的精气不足，摄纳无权，气浮于上；或肺气久虚，久病及肾，均可导致肾气亏虚，肾不纳气，肺所吸入之清气不能潜藏于肾，而导致呼吸表浅，甚则气喘等症。《素问·逆调论》云：“肾者，水脏。主津液，主卧与喘也。”此外，肺与肾之间的阴气也是相互资生的，肺阴虚可损及肾阴，肾阴虚亦不能上滋肺阴，故肺肾阴虚常并见。
中医认为“肺主通调水道”，“肺主行水”，“肺为水之上源”，肺对体内水液的输布、运行、排泄起着疏通和调节作用；此外，中医又认为“肾主水”，肾中精气的气化功能，对于体内津液的输布和排泄，维持津液代谢的平衡，起着极为重要的调节作用。肺主通调水道，肾为主水之脏，肺肾协同，保证水液的输布与排泄。
清代医家唐宗海在《血证论》提到：“肺为水之上原，肺气行则水行。”水液代谢过程中，由人体从外界摄入到胃、大肠、小肠的水液，经脾气的转输，上行于肺，经肺气的宣发，清者布散周身，浊者由肺气的肃降作用下输至肾与膀胱。而肺的宣发肃降和通调水道，亦有赖于肾阳的蒸腾气化。肾本身就是一个水脏，对水液有直接蒸化作用，且对整个水液代谢过程中的各个器官都有调节、推动、促进作用。肾阳的蒸腾气化，使肺气得以宣发，输津于皮毛，而肾气所蒸化的水液，依赖于肺气的肃降功能才能使之下归于肾和膀胱。因此，肺失宣肃，通调水道失职，必累及于肾，而至尿少，甚则水肿。正如《素问·水热穴论》所云：“其本在肾，其末在肺，皆积水也。”
根据五行学说，肺病及肾为母病及子传变。如《类经·疾病类·五脏虚实病刺》云：“肺病连肾，以气陷下部而母病及子也。”根据肺肾的生理功能，肺病及肾可见以下几方面的病理改变：
肺肾共同参与水液代谢，肺为“水之上源”，肾主水功能有赖于肺宣发肃降和通调水功能的正常。如肺受火热毒邪，燔灼津液，肺为水之上源，上焦有热，则可绝水之源，而见小便不利。如《明医杂著·附方》曰：“肺金有热，不能生肾水，而小便不利。”在临床上，重症肺炎患者可合并出现急性肾损伤，而导致小便量少。
若肺病风水，肺气不降，亦可累及肾，母病及子，膀胱气化不利，而致尿少，甚至导致水肿。如《内经知要·病能》曰：“肺主皮毛，风寒在表，故汗出中风，母病传子，故肾病而小便数而欠也。”这类病理改变的典型代表为上呼吸道感染后继发肾小球肾炎的患者，为急性改变，治疗时应该注意宣肺行水。
除了肺实证而致水道壅塞外，肺气虚衰同样可致肾气亏虚，而致肾失固摄，见小便淋漓或小便失禁。
“肺为气之主，肾为气之根”。若肺气久虚，日久及肾，必致肾不纳气，可见动则气喘之证。从五脏相关而言，为金不生水，如《石室秘录·逆医法》云：“盖喘病虽是肾虚，毕竟肺虚，不能生肾水也。”因此，这类病理改变多见于久病内伤，如《医学心悟·喘》中所云：“夫外感之喘，多出于肺，内伤之喘，未有不由于肾者。”而在治疗上，《类证治裁·喘症》亦指出“喘由外感者治肺，由内伤者治肾”的总体思路。在临床上，这种病理改变常见于慢性阻塞性肺病、慢性肺间质纤维化等慢性肺病患者，治疗上应在健脾补肺基础上，兼以纳气平喘。
如前所述，肾主一身之水，肺的宣发肃降和通调水道，亦有赖于肾阳的蒸腾气化。若肾阳虚衰，则一身之水凝滞而不化，形成水湿痰饮等阴邪，阴邪犯肺，则子病及母，正如《素问·水热穴论》云：“故水病下为胕肿、大腹，上为喘呼不得卧者，标本俱病。”又云：“其本在肾，其末在肺，皆积水也。”水邪泛滥，上逆于肺，出现喘息不得平卧，是水病的标末。
肾为先天，各脏病久，均可累及肾脏，而导致肾气亏虚。“肺为气之主，肾为气之根”，肾气一虚，则肺气虚浮而无根，致使肺之宣肃失常而出现咳嗽、喘促等症状。如在临床上咳嗽变异性哮喘多是由于病久伤及肾阳，肾阳不足损及肺阳，肾不纳气，肺主气司呼吸异常，而导致气急哮喘，呼多吸少，动则气喘等，治疗上应该以温肾纳气为主。