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还有一个猜想，坚持认为孤独症谱系障碍儿童无法解读别的儿童或成人的情绪。早期研究表明，孤独症谱系障碍儿童看到别人面部表情时，脑部用来加工这些信息的部位不同于没有孤独症谱系障碍的普通儿童。这个研究似乎支持了“孤独症谱系障碍儿童的脑部异于常人”的观点。不过，威斯康星大学的莫顿·根斯巴赫（Morton Gernsbacher）及其研究团队重新做了其中某个研究之后，发现原始研究中的被试可能并没有注视过别人的面部。当他们采取鼓励措施让被试注视别人面部时，发现被试和没有孤独症谱系障碍的普通儿童一样，使用相同的大脑部位扫描并加工这些面部影像。这些被试也能够运用与“普通儿童”一样的方式来加工这些面部表情信息。换句话说，早期研究的结果表明：孤独症谱系障碍儿童不太注视面部，而并非显示出不同的脑部生理机能。
根斯巴赫及其研究团队意识到：对感觉刺激反应过度的儿童及成人若太快注视别人的面部，常常会感到紧张。事实上，当被试注视别人的脸孔时，会显得焦虑不安。因此建议在帮助孤独症谱系障碍儿童时，不但要帮助他们克服紧张感，还要让他们能从观察别人面部和情绪表情的过程中得到许多乐趣。
这个研究显示，与孤独症谱系障碍相关的一些问题其实相当复杂且微妙；此外，如果研究者无法提出所有可能的假设，即使一项计划周密的研究也会出现错误的结论。关于孤独症谱系障碍儿童的能力，一个最强有力的事实是：在这些儿童当中，有许多确实发展出了更高层次的思考能力。这些儿童也许从一开始就被误诊了，他们不是孤独症，但这变成了一个循环论证。这些儿童确实一开始符合《精神疾病诊断与统计手册》第四版有关孤独症谱系障碍的诊断标准，而且后来也确实到达了更高层次的抽象及反省式思维阶段。