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《三三医书·临证综合秘本五种》包括《医学妙谛》《医学说约》《医脉摘要》《医易一理》《医事启源》等五部著作。
《医学妙谛》主要论述多种内科杂病和五官科疾病常见病之病因、病理、脉象、药理和治法。《医学说约》以风、寒、暑、湿、燥、火、脾胃、气、血、痰等门为纲，以各门之主症立论为目，扼要叙述了以内科杂病为主的多种常见病的病因、证脉及治疗。《医脉摘要》先从外感、内伤、伤寒六经、脏腑病证等方面辨别疑似证候，再述验舌诊脉之方法，附以时方歌、药性赋。《医易一理》以易理解释医理，配合图说，对研究易理与医学的联系有所帮助。《医事启源》中举了大量的例子，历征古书说明西医诸术其源皆出于中国。
五本书以介绍疾病的诊治为主。《医学妙谛》和《医脉摘要》均附有歌诀，或言病因治法，或言药性方剂，便于读者阅习。