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周鸿祎如此回忆道：“这次面临的商业危机已经超过了我人生中经历过的任何一次……风波之大已经超出我的想象，我们对事情似乎也已经失去了最终的控制……这里除了涉及两家公司的商业竞争之外，还涉及几亿互联网用户对于过往使用习惯的放弃，涉及中国网民在社交与安全之间的权衡。”
如果说此前的争斗马化腾还可以容忍的话，那现在对于周鸿祎和360动摇腾讯根本的做法，马化腾只可能暴跳如雷，没想到就是这样一个看似不起眼的对手却给他带来了巨大的麻烦，这是让他难以释怀的。因此，他和腾讯必须进行更为强势的反击。
面对短时间内数以千万计的用户损失，腾讯向深圳公安局报案，并且向工信部投诉，马化腾觉得360的所作所为是一种明目张胆的对大规模数量级客户端软件劫持的非法行为，如果任由这种非法行为持续，腾讯用户可能会在短短的一周之内就流失大部分，这对于腾讯是毁灭性的打击，他们希望能通过公安局和工信部得到支持和帮助。
在接连出手之后，腾讯还拿出了撒手锏，他们认为这样下去对腾讯的负面影响是很大的，加之腾讯对于用户还是非常有信心的，这是基于腾讯多年发展累积的用户以及培养的用户习惯，他们希望用户能够在腾讯与360之间做出明确的选择。之所以做出这样的决策，腾讯是有着慎重的考虑的，不是意气用事，而是对于用户的忠诚度有高度的自信。在权衡利弊之后，腾讯最终做出了这样的决策，马化腾和高管们草拟了一份公告，主要内容就是，所有QQ用户有两个选择：要么卸载360，要么卸载QQ。
对此，周鸿祎如此回忆道：“这次面临的商业危机已经超过了我人生中经历过的任何一次……风波之大已经超出我的想象，我们对事情似乎也已经失去了最终的控制……这里除了涉及两家公司的商业竞争之外，还涉及几亿互联网用户对于过往使用习惯的放弃，涉及中国网民在社交与安全之间的权衡。”
给用户提供一个二选一的机会，将选择的权利交给用户，将用户的选择作为最终人心向背的参考。腾讯这一招算是险招，但也并不是完全的临时起意，而是在有较大把握的基础之上的剑走偏锋。这一招也无疑给了周鸿祎和360一个巨大的打击，毕竟，腾讯的用户习惯早已形成。
在QQ安全中心核心功能与360安全卫士相似的情况下，大多数的QQ用户还是倾向于选择QQ安全中心的，毕竟，它可以替代360安全卫士。用户获得的是同样的安全功能方面的保障，但是360却不能为用户提供QQ所能够提供的安全之外的其他功能。
随着3Q大战的持续进行，网络上的舆论热度也在持续着。在这种情况下，工信部原本就比较关注这一热点事件，在收到腾讯的投诉之后，他们认为如果这样持续下去，最终会影响到用户。于是，工信部召集腾讯和360两家公司，作为调停者，对两家进行调停，希望它们能够顾全大局，要求360和腾讯停止相互攻击，向用户道歉，杜绝类似行为再次发生。此后，两家公司发布道歉公告，结束了大战。
原本是商场上的竞争，结果却引发了广泛的关注，影响到了大规模的网络用户，造成了很大的社会影响，最终工信部、中国互联网协会通过行政命令的方式要求360与腾讯双方不要再争执，这一影响巨大的大战才落下帷幕。
至此，360和腾讯各自鸣金收兵，引得全国几亿人关注的“3Q大战”才就此戛然而止。
虽然双方的大战结束了，但是官司还没有结束。2013年4月25日，广东省高级人民法院对此案做出了一审判决，奇虎公司构成不正当竞争，判令其赔偿腾讯公司经济损失及合理维权费用500万元。随后，奇虎360上诉，二审维持一审法院的判决。至此，3Q大战以360败诉结束，并且赔偿腾讯500万元的损失。
对周鸿祎来说，虽然败诉，但是他用户至上的执念却得到了进一步的强化，这也是他的初衷。
周鸿祎和360对于用户隐私的关注和保障让他们和互联网老大腾讯展开了正面交战，这其中折射出的用户至上的执念正是周鸿祎在创立360之后一直贯彻的，也是360发展的根基。