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过敏性鼻炎-哮喘综合征的发病原因主要包括两个方面，即过敏性鼻炎-哮喘综合征患者的体质和环境因素。患者的体质包括“遗传素质”、免疫状态、精神心理状态、内分泌和健康状况等主观条件，是患者易感过敏性鼻炎-哮喘综合征的重要因素。环境因素包括各种变应原、刺激性气体、病毒感染、居住的地区、居室的条件、职业因素、气候、药物、运动（过度通气）、食物以及食物添加剂、饮食习惯、社会因素甚至经济条件等均可能是过敏性鼻炎-哮喘综合征发生发展的重要原因。过敏性鼻炎-哮喘综合征发病率的增高趋势也与患者的过敏性体质导致的易感性和环境因素有关。
环境因素在过敏性鼻炎-哮喘综合征的发病中可能具有重要作用。环境中变应原的接触对于呼吸道过敏患者基因的表达往往是必需条件，环境中变应原的浓度经常可以决定过敏性鼻炎-哮喘综合征基因的表达水平。现代医学认为过敏性鼻炎-哮喘综合征患者呼吸道变应性炎症的形成为诸多因素综合作用的结果，临床工作者应分清主次因素，才能有的放矢地开展防治工作。此外患者初次接触上述不良环境因素的年龄、不良环境的恶劣程度、接触的频率以及接触持续的时间也是决定患者是否由过敏性鼻炎或哮喘转变为过敏性鼻炎-哮喘综合征的重要因素，同时也是决定过敏性鼻炎-哮喘综合征患者预后和转归的关键因素。在日常生活中某些诱发过敏性鼻炎-哮喘综合征的环境因素如尘螨、真菌、花粉等变应原以及病毒和气候变化等往往持续存在而较难避免，加上随着现代生活水平的提高，新的变应原频频进入人们的生活领域，人们出差、旅行、度假等机会也增多，活动地域在不断扩大，所以变应原的接触范围也增大，因此过敏性鼻炎-哮喘综合征的防治往往较为困难，甚至防不胜防。