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临床考虑为流感后，需要进行相应的流感病原学检测，以下1种或1种以上病原学检测结果阳性的患者，可以确诊流感：
（1）流感病毒核酸检测阳性。采用逆转录聚合酶链式反应（RT-PCR），最好是实时-定量RT-PCR法检测呼吸道病毒标本（如鼻咽拭子）中的流感病毒核酸。
（2）流感病毒快速抗原检测阳性。使用单克隆抗体区分甲、乙型流感，一般可在数小时内获得结果，但需结合流行病学史综合判断。
（3）流感病毒分离培养阳性。从呼吸道标本中分离出流感病毒，如果是在流感流行季节，建议流感样病例快速抗原诊断和免疫荧光法检测阴性的患者也应进行病毒分离。
（4）急性期和恢复期双份血清的流感病毒特异性IgG抗体水平呈4倍或4倍以上增高。此种办法只具有回顾性诊断意义。