问题
R语言开发,哪个工具最好用?
引言
RStudio是R语言开发中的利器,是最好用的R语言IDE集成环境。RStudio Server更是利器中的神器。不仅提供了Web的功能,可以安装到远程服务器上,通过Web进行访问,还支持多用户的协作开发。如此神器,快来动手试一下吧。
RStudio是一个强大的、免费的、开源的R语言集成开发环境的应用软件,可以安装在Windows、Linux和Mac不同操作系统上。RStudio Server是一个基于Web访问的RStudio云端开发环境,需要安装在Linux服务器上面,支持多用户远程访问使用。
本文使用的系统环境是:
·Linux:Ubuntu Server 12.04.2LTS 64bit
·R:3.0.1x86_64-pc-linux-gnu
·IP:192.168.1.13
注 RStudio Server只支持Linux系统环境。下载最新版本RStudio Server的地址是http://www.rstudio.com/ide/download/server.html。
在Linux Ubuntu环境中,下载并安装64位的Rstudio Server:
~ sudo apt-get install gdebi-core ~ sudo apt-get install libapparmor1 # Required only for Ubuntu, not Debian ~ wget http://download2.rstudio.org/rstudio-server-0.97.551-amd64.deb ~ sudo gdebi rstudio-server-0.97.551-amd64.deb
安装后,RStudio Server会自动启动运行。
~ ps -aux|grep rstudio-server # 查看RStudio Server 运行进程 998 2914 0.0 0.1 192884 2568 ? Ssl 10:40 0:00 /usr/lib/ rstudio-server/bin/rserver
可以看到,RStudio Server的服务已启动,8787端口被打开。
通过浏览器,我们访问RStudio Server:http://192.168.1.13:8787,IP地址为RStudio Server服务器的地址,如图1-6所示。
图1-6 RStudio Server登录界面
RStudio Server登录需要用Linux系统的用户账号。如果想增加或减少用户,直接对Linux系统用户进行操作就可以了。我的环境中用户登录,用户名是conan,密码是conan111。登录之后看到的界面如图1-7所示。
图1-7 RStudio Server的Web界面
1.RStudio Server的系统配置
RStudio Server主要有两个配置文件,默认文件不存在。
/etc/rstudio/rserver.conf /etc/rstudio/rsession.conf
设置端口和ip控制:
~ vi /etc/rstudio/rserver.conf www-port=8080 # 监听端口 www-address=127.0.0.1 # 允许访问的IP 地址,默认为0.0.0.0
重启Rstudio Server服务器,配置生效:
~ sudo rstudio-server restart
会话配置管理:
~ vi /etc/rstudio/rsession.conf session-timeout-minutes=30 # 会话超时时间 r-cran-repos=http://ftp.ctex.org/mirrors/CRAN/ # 设置CRAN 资源库
2.RStudio Server 的系统管理
启动、停止、重启RStudio Server服务器的命令如下:
~ sudo rstudio-server start # 启动 ~ sudo rstudio-server stop # 停止 ~ sudo rstudio-server restart # 重启
查看运行中的R进程:
~ sudo rstudio-server active-sessions PID TIME COMMAND 6817 00:00:03 /usr/lib/rstudio-server/bin/rsession -u zd
指定PID,停止运行中的R进程:
~ sudo rstudio-server suspend-session 6817 ~ sudo rstudio-server active-sessions # 再次查看进程 PID TIME COMMAND
停止所有运行中的R进程:
~ sudo rstudio-server suspend-all
强制停止运行中的R进程,此操作优先级最高,立刻执行。
~ sudo rstudio-server force-suspend-session <pid> ~ sudo rstudio-server force-suspend-all
RStudio Server临时下线,不允许Web访问,并给用户友好的错误提示:
~ sudo rstudio-server offline rstudio-server start/running, process 6880
RStudio Server上线:
~ sudo rstudio-server online rstudio-server start/running, process 6908
RStudio Server的其他操作和单机版的RStudio一样。
1.增加新用户和新用户组
~ sudo groupadd hadoop # 创建Hadoop 用户组 ~ sudo useradd hadoop -g hadoop # 创建Hadoop 用户并加入到Hadoop 用户组 ~ sudo passwd hadoop # 设置Hadoop 用户的密码 ~ sudo adduser hadoop sudo # 增加Hadoop 用户到sudo 组 ~ sudo mkdir /home/hadoop # 创建Hadoop 用户的home 目录 ~ sudo chown -R hadoop:hadoop /home/hadoop # 给/home/hadoop 目录及子目录,设置用户权限
以Hadoop用户登录,检查用户是否设置成功
~ ssh hadoop@localhost # 通过 ssh 远程登录 ~ bash ~ pwd # 查看登录后的访问目录 /home/hadoop
新打开浏览器窗口通过Hadoop账号登录,如图1-8所示。
图1-8 以Hadoop账号登录
2.Git代码共享
首先安装Git:
~ sudo apt-get install git ~ ssh-keygen -t rsa # 生成rsa 密钥对 ~ cat /home/conan/.ssh/id_rsa.pub # 查看公钥 ssh-rsa AAAAB3NzaC1yc2EAAAADAQABAAABAQDMmnFyZe2RHpXaGmENdH9kSyDyVzRas4GtRwMNx+qQ 4QsB8xVTrIbFayG2ilt+P8UUkVYO0qtUJIaLRjGy/SvQzzL7JKX12+VyYoKTfKvZZnANJ414d6oZpbDw sC0Z7JARcWsFyTW1KxOMyesmzNNdB+F3bYN9sYNiTkOeVNVYmEQ8aXywn4kcljBhVpT8PbuHl5eadSLt 5zpN6bcX7tlquuTlRpLi1e4K+8jQo67H54FuDyrPLUYtVaiTNT/xWN6IU+DQ9CbfykJ0hrfDU1d1LiLQ 4K2Fdg+vcKtB7Wxez2wKjsxb4Cb8TLSbXdIKEwSOFooINw25g/Aamv/nVvW1 conan@conan-deskop
接下来,我们需要把本地项目上传到Github。首先在Github上创建一个新的项目rstudio-demo,地址为https://github.com/bsspirit/rstudio-demo,通过下面的操作上传本地目录到rstudio-demo项目。
~ mkdir /home/conan/R/github # 创建rstudio-demo 项目目录 ~ cd /home/conan/R/github ~ git init # 初始化Git ~ git add # 增加当前目录及子目录到本地Git 库 ~ git commit -m 'first comment' # 在本地Git 库提交 ~ git remote add origin git@github.com:bsspirit/rstudio-demo.git # 绑定当前目录和github 的项目 ~ git push -u origin master # 上传本地Git 库中的代码到Github
打开RStudio设置到/home/conan/R/github目录,tools–>version control –>project setup,如图1-9所示。
图1-9 在RStudio中,配置Github地址
在RStudio中修改sayHello.r的代码:
sayHello<-function(name){ print(paste("hello",name)) }
sayHello("Conan") sayHello("World")
点击tools–>version control–>commit提交,如图1-10所示。
图1-10 通过RStudio进行Git操作
上传到Github,只需要点击tools–>version control–>push,如图1-11所示。
图1-11 在Github上查看提交的操作
RStudio有如此强大的功能,极大地降低了编程的门槛。还没有用过的同学,赶紧去体验一把极客的感觉吧!