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孙思邈另一不同寻常之处，即寿高一百四十一岁。关于此事，一些人持怀疑态度。导致这一疑问者，乃《旧唐书·孙思邈传》中，只确认孙氏辞世之年——唐“永淳元年”（682），未标明孙氏出生之岁。《新唐书·孙思邈传》中，亦只言孙氏“永淳初卒，年百余岁”，同样未注明诞辰之年。
《旧唐书·孙思邈传》中，为何未能确认孙思邈诞辰之岁？原是该文中有一段模糊记载，引发诸多歧义。记述者为“初唐四杰”之一的卢照邻，时间为癸酉之岁（673）。
卢照邻文曰：“思邈自云：开皇辛酉岁生，至今年九十三矣。”此即疑问源由。原来“开皇辛酉岁生”和“至今年九十三矣”两说看似确切，却不能聚焦于同一年份。开皇为杨坚年号，始于公元五八一年，止于公元六〇〇年十二月。这二十年内，有“辛丑”而无“辛酉”。而按“至今年九十三”（虚岁）推断，即孙思邈诞生之年，恰与“开皇辛丑”相符，这就是公元五八一年。
不过，卢照邻当时就怀疑“至今年九十三”说法，认为孙思邈是在“打哑谜”。故他随即又道：“（经本人）询之乡里，咸云数百岁人。话周、齐间事，历历如眼见。以此参之，不啻百岁人矣。”可知孙思邈当年与卢照邻相见时，早已超过百岁。
因之另有学者认为，那“开皇辛酉”并非杨坚开皇一朝，而是西魏大统七年（541），因那年刚好是“辛酉”年，杨坚也在这一年降生。此则可以释为：孙思邈所云“开皇”，即代指隋文帝杨坚（正如史家以“贞观”代指唐太宗李世民一样）。所谓“开皇辛酉岁生”，意即“于隋文帝诞辰的‘辛酉’年降生”。
此即孙思邈出生“两说”缘由。古人不欲妄判，乃将疑团存留。
该疑问延至清代，却由《四库全书》总编修纪晓岚轻易“解答”。纪氏认为：照邻乃思邈弟子，记其师言，必无妄语。于是纪晓岚断言：卢照邻所记“开皇辛酉”乃“开皇辛丑”之误，孙思邈就生于“开皇辛丑”之年，寿高一百零一岁。至于孙思邈“生于后周，隐居不仕之说，为史误审矣”！
有了纪晓岚这武断一说，某些后学者便依样画葫芦。别的不表，那权威《辞海》“孙思邈”词条的编撰人，即为依样画葫芦者之一，断然标注：“孙思邈（581—682）”。
同样权威的《辞源》则较谨慎，在“孙思邈”词条下标注：“孙思邈（公元581年？—682年）”。
为考证孙思邈出生之年，当代学者乾祖望在《孙思邈评传》中专辟一章，综合诸家之说进行比较，结论是孙思邈生于西魏大统七年（541）。
即坚持卢氏“开皇辛酉岁生”之说。
本传记作者亦认为孙思邈生于西魏大统七年。支持这一结论者，有如下五条证据：
其一，《旧唐书·孙思邈传》云：孙思邈年少之时，有人将他推荐给洛州总管，“洛州总管独孤信见而叹曰……”一个“见”字，证明两人有过交往。而据史载，独孤信于公元五五七年遭人陷害，被迫自杀。若孙思邈生于公元五八一年，两人怎得相“见”？
其二，《旧唐书·孙思邈传》亦云：“周宣帝时，思邈以王室多故，乃隐居太白山。隋文帝辅政，征为国子博士，称疾不起（赴）。”史载，周宣帝在位，自公元五七八年六月至公元五七九年。若孙思邈生于五八一年，即与周宣帝风马牛不相及。又“隋文帝辅政”之说，专指周宣帝自称天元皇帝（太上皇）这短暂一段，时为公元五七九年二月至公元五八〇年五月，随即损寿早逝。此期表面“当国”者，为周宣帝七岁幼子周静帝，实际主政者，即太师杨坚。周宣帝一死，周静帝便成为彻底的傀儡皇帝。公元五八一年二月，周静帝被废，杨坚自己称帝。若孙思邈生于五八一年，亦谈何杨坚在辅政时期“征为国子博士”？
其三，孙思邈在《千金要方·肝脏·坚积聚第五》中自述：余“治蛟龙病。开皇六年三月八日，有人食芹得症……令服寒食饧三斗，大验”。（按：孙思邈记载此事，时间具体到年、月和日，说明印象极深，非亲身经历不可。）这就说明，孙思邈此时已经成年，从医经验非常丰富。而开皇六年为公元五八六年，若他出生于公元五八一年，则该年才刚五岁，显然不合情理。唯其出生于公元五四一年，已是四十五岁年纪，才能从事救死扶伤的医疗临床。
其四，据《旧唐书·孙思邈传》记载：“及太宗即位，召诣京师，嗟其容色甚少”，不由大发感慨：“故知有道者诚可尊重，羡门、广成，岂虚言哉！”（按：李世民于二十八岁登基，为公元六二六年。）若孙思邈生于公元五八一年，即届年不过四十五岁而已，李世民用得着“嗟其容色甚少”？唯其生于公元五四一年，已是八十五岁高龄，却因凸显年轻，才让李世民惊羡不已。李世民从来相信有羡门、广成等长生不老神仙存在，乃觉孙思邈堪可类比。
其五，据孙思邈在《千金翼方·针灸上·取孔穴法第一》中自云：“吾十有八而志学于医，今年过百岁，研综经方，推究孔穴。”据考证，孙思邈于公元六五二年完成《千金要方》，其后又用了近三十年时间，完成《千金翼方》。他若生于公元五八一年，即公元六五二年才七十一岁，自称“今年过百岁”还得再等三十年。而三十年后是公元六八二年，孙思邈于该年仙逝，哪还有时间写作《千金翼方》呢？唯其生于公元五四一年，完成《千金要方》时已满一百一十一岁，才有资格自称“今年过百岁”，也才有时间开始第二部著作的构思和写作，并一边写作，一边继续“研综经方，推究孔穴”。
关于孙思邈的生平事迹，古籍录之不详。究其原因，一是医家往昔地位甚微，长期归入方技者类，士大夫耻与医者为伍。二是与他晚年所处时代有关。那时已由武则天当国，皇帝李治主动退居其后。而孙思邈曾开罪于武则天，难免遭受打压。孙思邈一生波澜壮阔，除在民间长期行医、救助芸芸众生外，还侍奉过隋文帝杨坚、隋炀帝杨广、唐高祖李渊、唐太宗李世民、唐高宗李治等多个皇帝，并有杨坚之独孤氏皇后、李世民之长孙氏皇后、李治之武则天皇后等受其侍奉。他战战兢兢，如履薄冰，数度险遭不测，却凭其诚挚品格与独有智慧，一次次化险为夷。
信史所载孙思邈事迹虽少，各种奇传却多。本传作者从“孙思邈是人不是神”这一基本观点出发，努力还原先贤真实面貌，既不取野史的荒诞之说，亦剔除“信史”中夸张之辞。只将孙思邈两部巨著视作记传第一手资料，透过字里行间，探寻著者行踪。再拣出书里透露的点滴行踪，反复甄别，形成相对缜密的整体，便是面前这一部传记。其中难免有谬误之处，敬希读者不吝赐教。