拷贝数变异(copy number variation,CNV)是由基因组发生重排而导致的,一般指长度为1kb以上的基因组大片段的拷贝数增加或者减少,主要表现为亚显微水平的缺失和重复。CNV是基因组结构变异(structural variation,SV)的重要组成部分。CNV位点的突变率远高于SNP(single nucleotide polymorphism),是人类疾病的重要致病因素之一。CNV的基因常影响人体对外界环境的反应,在细胞连接、感观理解、化学刺激、神经生理过程中发挥重要作用。非CNV的基因常是剂量敏感基因,维持细胞的生长发育,包括细胞信号转导、增殖、磷酸化等过程。由于CNV可以改变基因的表达量,从而造成个体间的差异,包括一些疾病如微缺失综合征和复杂的多基因疾病的发生。DiGeorge综合征、Williams-Beuren综合征、婴儿痉挛和Smith-Megenis综合征均是微小片段缺失综合征。还有复杂的多基因病包括精神分裂症、孤独症和智力低下等。
关于拷贝数变异与遗传代谢性疾病的关系目前报道较少。2014年Nicolas G1等报道一种与内分泌或生化因素相关的常染色体显性遗传性疾病——特发性基底节钙化(idiopathic basal ganglia calcification,IBGC)与CNV相关,该病的致病基因为SLC20A2、PDGFRB和PDGFB,Nicolas G1研究小组对27名三个致病基因都没有突变的患者进行了CNV的分析,结果发现1名患者PDGFB基因存在外显子2~5的杂合缺失。这也提示我们当某种遗传代谢性疾病的致病基因未检测到点突变时,可以考虑基因内部或其他区域的CNV。