拉马克的生物进化理论问世后，一直未能成为主流思想。一方面由于当时古生物证据匮乏，另一方面是有着“第二个亚里士多德”之称的某位大科学家极力反对。这位科学家就是居维叶。

法国自然主义者、动物学家和博物学家居维叶，出生于法国的蒙贝利亚尔，从小被称为神童，出众的才能让他似乎毫不费力就平步青云，从一个法兰西退役军人的儿子一步步变成国立自然博物馆教授、法兰西科学院院士、参议员和内政部主席，并且历经动荡的法国大革命时期、拿破仑时期和君主复辟时期而屹立不倒。

尽管身负繁重的政务，居维叶仍然善于利用时间，在多个科学领域都有建树。他最重要的不朽贡献之一是使人们接受了动物物种是会灭绝的这一事实。1796年，他首先指出非洲象与亚洲象是两个不同的物种，而猛犸象则是一种更接近于亚洲象的动物物种，在很多年前就已经在地球上消失，即“灭绝”了。

1800—1805年，居维叶的《比较解剖学讲义》5卷本相继出版，首次试图确立人和动物躯体结构的规律，把人类明确地归入了脊椎动物一类，并阐明了人类与其他类别的根本区别。居维叶根据对动物的比较解剖学分析，提出了“器官相关”理论，认为动物的身体是一个统一的整体，身体各个器官在功能上是有联系的。例如，牛、羊等食草的反刍动物有着能磨碎植物纤维的牙齿，这牙齿与它们的咀嚼肌、上下颌骨和肠胃等在功能上彼此关联，构成了一个整体，最终实现反刍这一功能。而虎、狼等肉食动物，则体格适于捕捉猎物，它们的牙齿、肠、胃等消化道方面的结构和机能也很适合撕烂、咀嚼和消化肉类。生物体各器官的结构与功能是生物与环境交互影响的结果，生物性状则是各器官功能的综合体现。居维叶的理论在很大程度上启发了人们对形态学进行研究。根据这一理论，居维叶在动物化石的基础上成功复原了已灭绝的动物形貌，他本人也成为近代古生物学和比较解剖学的奠基者之一。

居维叶推论，由于物种各器官对环境的适应极为精确，任何变异都将令个体无法存活，因此生物是不可能进化的。他解剖了拿破仑从埃及带回来的猫和鸟的木乃伊，发现几千年前的动物与现在见到的动物在结构上没什么差异，这一发现更坚定了他反对生物进化理论的立场。居维叶认为生物体的相似之处，不是来源于同一祖先，而是功能相同的后果：功能决定形态，形态不决定功能。他的观点与当时的布丰、拉马克和圣伊莱尔等认为生物形态是可以改变的相左。居维叶认为，按照物种可变理论，那么各种类型的动物之间应该有些过渡类型，才能说明生物逐渐变化的过程。然而在那个时代，古生物化石还很稀少，没法用于证明生物变化的学说。而且，居维叶当时学术地位很高、影响很大，因此物种不变理论就这样统治着生物学界，直到50年后达尔文证实物种是可变的。