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种子具有体积小、重量轻、产量大、便于长途运输和长期储藏等特点，多用于草本植物杂交育种。
种子处理的目的是为了让种子发芽迅速、整齐，而且还可以杀死部分附着在种子表面的菌丝，并可将孢子、虫卵等去掉。不同类型种子的处理方法不同，具体如下。
容易发芽的种子（如半枝莲、茑萝等很多草本植物的种子）可以直接播撒，也可以用冷水或40℃以下的温水浸泡24小时后再播撒，以缩短种子在土壤中吸水膨胀的时间，加快出苗，而且在浸种过程中能将不饱和的种子和杂物去除。
种皮厚且坚硬的种子（如美人蕉、荷花、夹竹桃等的种子）吸水和破壳都很困难，浸种前，要用利刃刻破或磨破种皮的空端。大量处理时，还可以使用强酸、强碱等浸蚀几分钟或几小时，至种皮变软，立即用清水冲洗干净，切忌酸碱渗入种皮。
不易发芽的种子（比如冬珊瑚、文竹、天门冬等的种子）播种前应进行催芽。把浸透的种子放在浅盘中，薄薄摊开，上面盖上棉布或纱布，保持25℃左右的温度，每天用温水冲洗一次，待种子露白头后，立即播种。