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奶牛与其他家畜养殖一样，都存在一定的风险。主要表现在：
（1）市场风险 主要包括市场需求变化、政策时效性变化和同业竞争三个方面。如2014年2月以来，连续2年的高奶价戛然而止，原料奶价格一路走低，从2月的均价4.27元/kg，到2015年1月降至3.7元/kg，接近3.5元/kg的综合成本价。各地出现不同程度的“卖奶难”，倒奶、杀牛的情况时有发生。
（2）疾病风险 奶牛养殖最大的风险就是疾病，如口蹄疫、结核病、布鲁氏杆菌病、前胃疾病、蹄病、乳房炎、代谢病、繁殖障碍疾病等。奶牛疾病风险具有不确定性，是造成奶牛养殖业高风险的重要因素。疾病还会导致奶牛生产性能下降，严重时还会直接淘汰甚至诱发死亡，极大地损害了养殖户的利益，给产业带来很大风险，造成巨大经济损失。
（3）技术风险 主要指由于养殖者自身技术水平、管理经验和经营技巧的差异，造成奶牛疾病发生率、生产水平、经济效益的不同结果所带来的风险，直接影响养殖者的收益、投资信心甚至生活水平。如果养殖技术或经验不足，一旦发病，奶牛会出现生产性能下降甚至大批死亡的现象，会给养殖者造成巨大的经济损失。
（4）政策风险 如奶牛良种补贴政策、环保评价政策、乳制品加工相关政策（如生鲜乳生产收购管理办法）、市场流通相关政策、乳制品进出口贸易相关政策、乳品质量安全相关政策、全国兽药（抗菌药）综合治理五年行动规划、兽药国标化及国家奶牛进出口政策（中澳自由贸易协定）、粮改饲、奶牛保险等政策变化经过传导最终会影响乳制品生产的价格。
（5）环境风险 一是自然灾害因素，如地震、水灾、风灾、冰雹、霜冻等气象、地质灾害会给奶牛生产带来风险；二是国民的乳制品消费理念和消费水平也会影响其消费量；三是国家陆续出台的相关法律和法规，如《环境保护法》、《畜禽规模养殖污染防治条例》、《中华人民共和国食品安全法（修订草案）》、《中华人民共和国土地管理法》、2015年的中央1号文件《关于加大改革创新力度加快农业现代化建设的若干意见》。
（6）资金风险 奶牛养殖所需的投资很大，尤其是购买奶牛需要的流动资金更大，当前一头黑白花奶牛少则近万元，多则1.6万～1.8万元，甚至更高。如果一次购进50头奶牛，仅购牛成本一项就至少需要几十万元。同时，还有牛舍、设施、设备、饲料、水电、药物及人工等费用支出。因此，投资者应根据自身的资金情况确定饲养规模的大小，从而避免因缺乏足够的资金保障使得奶牛养殖不能顺利开展而形成资金风险。