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生殖系统是胎生动物繁殖后代、保证种族延续的器官总称。生殖系统有雄性和雌性之分，雄鼠和雌鼠各有一套生殖系统。生殖系统的功能是产生生殖细胞，繁殖新个体、分泌性激素和维持副性征。
雄鼠生殖系统由一对睾丸、一对附睾、一对输精管、精囊腺、前列腺、尿道球腺、尿生殖道、阴茎和其附属器官（精索、阴囊和包皮）组成。
睾丸一般呈左、右稍扁的椭圆形，一侧与附睾相连，称为附睾缘（margo epididymidis）；另一侧为游离缘（margo liber）。睾丸分为睾丸头、睾丸体和睾丸尾三部分。血管和神经出入的一端为睾丸头，睾丸头与附睾头（caput epididymidis）相连；另一端为睾丸尾，与附睾尾（cauda epididymidis）相连。睾丸在胚胎早期位于腹腔内腹股沟管内环处，出生前后逐渐下降，快速通过腹股沟管而降至阴囊（scrotum）中，睾丸以上部位则闭锁。
睾丸的结构包括被膜、实质和间质。
（1）被膜（capsule） 睾丸的外面被覆一层浆膜性的固有鞘膜。固有鞘膜（tunica vaginalis propria）的深面是一层较厚的致密结缔组织，称为白膜（albuginea）。白膜从睾丸头部伸入睾丸内形成睾丸纵隔（corpus highmorianum）。纵隔中的结缔组织呈放射状向睾丸实质伸入形成睾丸小隔，将睾丸分成许多锥形小室，称为睾丸小叶（corpus highmorianum）。
（2）实 质（parenchyma） 睾丸的实质由曲细精管（seminiferous Tubules）、睾丸网（rete testis）和间质组织组成。
在每个睾丸小叶内有2～3条以盲端起始的、弯曲的曲细精管。曲细精管的生殖上皮能够产生精子。曲细精管伸向睾丸纵隔，在接近纵隔处变直，称为直细精管（seminiferous tubules）。
各个睾丸小叶的直细精管进入睾丸纵隔内，并相互吻合在一起呈网状，称为睾丸网。睾丸网汇合成6～12条较粗的睾丸输出管（testicular efferent duct）。睾丸输出管穿出睾丸头的白膜，进入附睾头。
（3）间 质（interstitial tissue） 内含有呈多角形或圆形的间质细胞（leydig cell），细胞体积大，核呈圆形，可分泌雄性激素。间质细胞之间可见毛细血管。
能够产生雄性生殖细胞——精子（sperm），同时也能分泌雄性激素（androgen）。
是储存精子和使精子进一步成熟的器官，附着在睾丸的附睾缘。附睾可分为附睾头（caput epididymidis）、附睾体（corpus epididymidis）和附睾尾（cauda epididymidis）三部分。
附睾是精子最后成熟的地方，具有吸收和分泌机能，是储存精子的场所；还具有运输精子的功能。
是输送精子的管道。起始于附睾尾的末端，进入精索，经腹股沟管（inguinal canal）上行进入腹腔，在腹腔内与精索血管分开，进而向后进入骨盆腔，沿骨盆腔侧壁移行至膀胱背侧形成输精管壶腹（ampulla of deferent duct），末端开口于尿道起始部背侧壁的精阜（seminal colliculus）上。
呈扁的圆锥形索状，基部附着于睾丸和附睾上，顶端达腹股沟管腹环（annulus abdominalis abdominis）。精索内除输精管外，还有血管、淋巴管、神经及平滑肌束［睾提肌（cremasteric coat of testis）］等。精索的外表面被有固有鞘膜，去势时应结扎和截断精索。
是一个袋状的腹壁囊。内有睾丸、附睾和大部分精索。位于腹部与肛门腹侧之间。阴囊壁的结构和腹壁相似，由外向内依次为阴囊皮肤（skin of scrotum）、肉膜（dartos）、阴囊筋膜和总鞘膜（tunica vaginalis communis）。
尿生殖道为尿液（urine）和精液（semen）排出的共同通道。起于膀胱颈（vesical neck），沿骨盆底壁正中向后方伸延，绕过坐骨弓（arcus ischiadicus），再沿阴茎腹侧的尿道沟（vesical neck）前行，开口于阴茎头（glans）。尿生殖道可分为骨盆部和阴茎部，两者之间以坐骨弓为界。
副性腺有精囊腺（seminal vesicle）、前列腺（prostate）和尿道球腺（bulbourethral gland）。副性腺的分泌物与输精管壶腹腺体的分泌物一起执行稀释精液、增加射精量及改善阴道环境等作用。
是排尿、排精和交配器官（copulatory organ），平时是柔软的，隐藏在包皮之内，交配时勃起（erecting）。
在阴茎头处褶成双层的皮肤管状鞘，有容纳和保护阴茎头的作用。
图1-129 大鼠生殖器官（一）
1—阴茎；2—睾丸
图1-130 大鼠生殖器官（二）
1—睾丸；2—附睾尾；3—前列腺；4—膀胱；5—精囊腺
图1-131 大鼠生殖器官（三）
1—睾丸；2—阴茎
图1-132 大鼠睾丸
图1-133 大鼠附睾
1—附睾头；2—附睾体；3—附睾尾
图1-134 大鼠精囊腺和前列腺
1—精囊腺；2—前列腺
图1-135 大鼠包皮腺等
1—包皮腺；2—阴茎；3—阴囊；4—肛门
图1-136 小鼠生殖器官
1—睾丸脂肪垫；2—睾丸；3—精囊腺
图1-137 小鼠睾丸
雌鼠生殖器官包括卵巢（生殖腺）、输卵管、子宫、阴道（生殖道）、尿生殖前庭、阴蒂、阴唇（外阴）及前庭腺等。
卵巢为雌鼠生殖系统的主要器官，产生卵子（ovum），并分泌雌性激素（estrogen）。
卵巢是雌鼠生殖系统中成对的实质器官，左右各一，位于4～5腰椎下。形状为椭圆形，卵巢表面有的呈结节状，有的是平滑的。卵巢以卵巢系膜（mesovarium）悬吊在腹腔肾的后下方或骨盆腔前口的两侧。后端以卵巢固有韧带（proper ligament of ovary）与子宫角（horn of uterus）相连；前端接输卵管伞（fimbriae of uterine tube）。分布于卵巢的血管和神经，随卵巢系膜出入卵巢，将卵巢系膜附着的部分称为卵巢门（hilum of ovary）。
卵巢由被膜和实质两大部组成。卵巢的实质包括皮质和髓质两部分，皮质在外周，髓质在中央。
（1）被膜 卵巢表面包有一层单层的扁平或立方上皮（unilaminar cuboidal epithelium），上皮下面有一层致密结缔组织形成的白膜。
（2）皮质 卵巢的皮质由基质（groundmass）、处于不同发育阶段的卵泡（groundmass）、闭锁卵泡（atretic follicle）及黄体（corpus luteum）等构成。皮质表面被覆有生殖上皮（germinal epithelium）。
①基质 由致密的结缔组织构成，含有大量的网状纤维（reticular fiber）和少量的弹性纤维（elastic fiber）。
②卵泡 每个卵泡都由一个卵细胞（ovum）和围绕在其周围的一些卵泡细胞（follicular cell）所构成。根据卵泡发育程度的不同，可将卵泡分为原始卵泡（primordial follicle）、生长卵泡（growing follicle）和成熟卵泡（graafian follicle）。很多卵泡在发育过程中退化形成闭锁卵泡（atretic follicle）。
具有产生卵子和内分泌（产生雌激素与孕激素）的双重功能。雌激素能促进雌性动物生殖器官的生长发育和第二性征的出现。孕激素（也称黄体酮）能促进子宫内膜的生长，从而保证受精卵的植入和维持妊娠。
（1）产生卵子作用 为不同发育阶段卵泡生长发育提供条件。
（2）内分泌功能 卵巢分泌的雌性激素有雌激素（estrogen）、孕激素（progestogen）和松弛激素，此外还分泌少量雄激素（androgen）。
是位于卵巢和子宫角之间的两条弯曲的细管，其作用是输送卵细胞，卵细胞受精和卵裂也在管内进行。末端借输卵管子宫口（uterine orifice of uterine tube）与子宫角（horn of uterus）相通。
图1-138 雌性大鼠生殖器官（一）
1—子宫角；2—卵巢
图1-139 雌性大鼠生殖器官（二）
1—肾；2—卵巢；3—子宫角；4—子宫
图1-140 雌性大鼠生殖器官（三）
1—卵巢；2—子宫角
图1-141 雌性大鼠生殖器官（四）
1—卵巢；2—子宫角；3—子宫韧带；4—阴道；5—膀胱
图1-142 雌性小鼠生殖器官（一）
1—卵巢；2—子宫角
图1-143 雌性小鼠生殖器官（二）
1—卵巢；2—子宫角
图1-144 雌性小鼠生殖器官（三）
1—卵巢；2—子宫角
图1-145 雌性小鼠生殖器官（四）
1—脂肪；2—卵巢；3—子宫角；4—阴道
图1-146 雌性豚鼠殖器官
1—阴门；2—尿生殖前庭；3—阴道；4—膀胱；5—子宫角；6—卵巢
子宫是胎儿发育成长的器官。子宫都由两个子宫角（uterine horn）、一个子宫体（uterine corpus）和一个子宫颈（uterine cervix）组成。两子宫角前接输卵管，向后汇合为子宫体。子宫大部分位于腹腔内，仅部分子宫体和子宫颈位于骨盆腔内。子宫背侧为直肠，腹侧为小肠和膀胱。在妊娠时，根据妊娠期的不同，子宫形态和位置会发生显著的变化。子宫的血管分布丰富［有卵巢动脉（arteria ovarica）、子宫动脉（arteria ovarica）和阴道动脉（vaginal artery）的分支分布］，这些血管在子宫的前端离子宫较近，在做子宫切除时，应注意结扎靠近子宫颈的子宫动脉。
阴道既是雌鼠的交配器官又是产道（birth canal）。呈左右压扁的管状，位于骨盆腔内。背侧为直肠，腹侧为膀胱和尿道。阴道前部因有子宫颈突入，而形成环形或半环形的凹陷，称为阴道穹隆（birth canal）。阴道向后与尿生殖前庭相连，二者在腹侧壁的交界处有尿道外口（external orifice of urethra），在尿道外口的前方，黏膜形成一横褶或环形襞，称为阴瓣（hymen）。
阴道前庭和阴门是尿液排出的通路，以阴门与外界相通。在尿道外口后方两侧有前庭小腺（lesser vestibular glands）的开口，在侧壁上有前庭大腺（greater vestibular gland）的开口，其分泌物在交配（copulation）和分娩（parturition）时增多，有润滑作用。阴门位于肛门（anus）的腹侧，由左右两片阴唇（labia）构成，两阴唇间的裂缝称阴门裂（rima vulvae），阴门裂的上下两端相连称阴门背联合和阴门腹联合。在阴门腹联合的前方有一阴蒂窝，内有小而凸出的圆柱状的阴蒂（clitoris）。阴蒂相当于雄鼠的阴茎，也由海绵组织（spongy tissue）构成，是两侧大阴唇的上端会合点，被阴蒂包皮包绕，其尖端膨大称阴蒂头。