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辅助功能有两种类型：一种是辅助功能（M代码）用于指定主轴启动，主轴停止，程序结束等；第二种是第二辅助功能（B代码），用于指定分度工作台定位。
当运动指令和辅助功能在同一程序段指定时，指令按下面的两种方法之一执行：
①移动指令和辅助功能指令同时执行。
②移动指令执行完成后，执行辅助功能指令。
选择哪种顺序，取决于机床制造厂的设定。
当地址M之后指定数值时，代码信号和选通信号被送到机床。机床使用这些信号去接通或断开它的各种功能。通常，在一个程序段中仅能指定一个M代码，在某些情况下，对于一些机床也可以最多指定三个M代码。具体代码对应的代码功能，由机床制造厂决定。除了M98、M99、M198或调用子程序或调用宏程序的M代码外，其他M代码由机床厂处理，见机床制造说明书。
M代码除了机床上使用的以外，还有一些是数控系统使用的，这些代码规定了特殊的意义，机床厂不能使用，具体代码如下。
①M02、M30：程序结束。M02为程序结束，M30使控制返回到程序的开头的操作。
②M00：程序暂停。在包含M00的程序段执行之后，自动运行停止。当程序停止时，所有存在的模式信息保持不变。用循环启动使自动运行重新开始。这随机床制造厂不同而有区别。
③M01：选择暂停。与M00类似，在包含M01的程序段执行以后，自动运行停止，只是当机床操作面板上的任选停机的开关置1时，这个代码才有效。
④M98：调用子程序。详细内容看子程序部分的说明。
⑤M99：子程序结束。表示子程序结束，并返回主程序继续执行，详细内容看子程序部分的说明。
⑥M198：调用子程序。这个代码用于在外部输入／输出功能中调用文件的子程序。