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地层是不完整的
我在上一章多次说明，地层的记录是不完整的。在这个地球上，仅仅有一小部分的地层被我们认真勘察过，只有某些纲的生物以化石的形式被保存下来。而且， 在我们的博物馆中收藏的化石和物种的数量，比起一个地层所经历过的数代生物，简直微不足道。
多数的连续地层中都存在长时间的间隔，因为只有在地层下陷时，沉积作用才容易将生物遗骸掩埋起来，并且形成足够深厚坚固的沉积地层，可以禁受未来的侵 蚀作用。在下沉时期，会有大量生物灭绝，而上升时期，虽然会产生较多的变异个体，但是地质记录往往被中断形成大段的时间间隔。
每个独立地层都不是在持续不断的沉积作用下形成的，每块地层的续存时间比起物种的平均生存时间，可能要短一些。任何区域或者任意一块地层中，首次出现 的新物种往往和物种迁徙有关。越是变异频繁、最容易出现新类型的物种，一般分布也越广泛。
变种最初都是在小范围内出现的。每个新物种的形成，中间一定经历了无数个过渡类型，其中的演变过程，用年来计算的话是非常漫长的，但和物种保持不变的 时期相比，却是非常短暂的。
将上面诸多因素综合起来，我们就可以说明为什么至今无法找到中间变种，能将所有的灭绝物种和现存物种用最小级的递进关系一环接一环地联系起来。我们必 须记住，尽管我们能辨别物种和变种，但是我们不清楚用什么标准来判断它们在进化史上的地位。在发现整个进化锁链之前，任何两个类型的中间类型都会被当成新的 、界线明显的、独立的物种来看待。
任何不承认“地层的记录是不完整的”这一观点的人，肯定也无法认同我的所有学说。他们会不断地提出许多毫无意义的问题，比如，在同一块地层的连续层位 中，发现的相似物种或者典型物种之间本应大量存在的中间类型在哪里？他们认识不到在连续的地层中存在大段的间隔时期。他们在研究某块地域广阔的地层时，以欧 洲地层为例，认识不到物种迁移在其中起到的作用。他们认为某些物种群是突然出现的，虽然这只是地层带给我们的假象。他们还会问，在寒武纪之前生存过的生物体 ，它们的遗骸在哪里呢？
我们已经确认的事实是，至少有一种动物在寒武纪之前就出现过。除此之外，我只能用下面的假设来作答了：
现在海洋所占据的地方，自古就已经以海洋的形式存在；发生过上升或者下沉的大陆地区，从寒武纪以来就形成了。但早在寒武纪之前，地球上的板块分布却与 现在完全不一样。那时存在的古老大陆，现在一部分成为变质岩遗留下来，一部分深深沉入海底，完全被海水覆盖。
如果能解决这些难题，那么古生物学上的其他重大发现，就能被自然选择学说和借由变异的发生推导出的生物起源学说解释清楚。
物种的演变是缓慢进行的
在本章，我将会详细阐述：为什么新的物种都是缓慢而持续不断地出现的。
为什么不同纲的物种其变异时间、变异速度和变异程度全都不一样，但却在很长一段时间内，所有物种都会出现不同程度上的变异。 旧的物种终究会被新 物种取代，走向灭绝。物种一旦灭绝，就再也不会出现。 物种群的数量总是呈现增长的趋势，但是它们存在的时间却各不相同。
变异的过程是非常缓慢的，同时受到很多错综复杂的偶然事件影响。从属于优势物种群中的物种，其后代无疑会继承这种优势，而且变异后代会形成新的亚群和 新的物种群。在新的物种群形成后，相对于优势物种群，处于劣势地位的物种群，其后代无疑也继承了这种劣势，这种劣势很有可能使它们没有机会再产生变异后代而 全部灭绝。这时，有一小部分后代可能因为生存在独立的不受侵害的地区，得以存活下来，所以物种灭绝也是一个非常缓慢的过程。一旦某个物种完全灭绝了，其世代 相传的锁链便被切断了，它将永远不会重新出现在地球上。
我还将解释：为什么那些分布广泛且出现较多变种的优势类型，它们的后代更容易扩散到世界各地，侵占更多的领地。
这些后代由于具备祖先身上的某些优势，更容易击败在生存斗争中处于劣势的物种。在经历过很长一段时间的地质间隔期后，地球上的生物便表现出一种同时变 异的结果。
我最后将说明：从古至今种类繁多的所有生物，为什么可以被归为很少的几个纲。
生物的性状在遗传过程中不断发生分歧：
●越是古老的物种，和现存物种比起来差异就越大。但是，古老的灭绝物种常常能把现存的两个类型联系起来，拉近原本看起来完全不同的两个类型之间的关系 ，甚至能将两个不同的类型群归到一个大群之下。
●越是古老的物种，其身上具备的特征往往涵盖的物种群的特征越多，看起来更像是介于几个现存物种之间的中间类型。
●越是古老的类型，越是存在于性状分歧的早期。那时物种之间的性状更为相似，亲缘性更近，与现今物种的早期祖先的差异也更小。
通常情况下，灭绝类型很难被直接归入现存类型，基本都是通过其他的灭绝类型迂回、间接地并到现存类型之间的。在紧密相连的地层中，生物遗骸之所以也是 密切相似的，就是因为世代遗传早已将它们紧密地联系起来。这也解释了为什么中间地层中的生物遗骸具备中间类型的特性。
生存在地球上各个历史时期的生物，通过生存斗争战胜了自己的祖先，使自己在进化等级上得到提升，生理构造更具功能性，看起来更加高级。所以，很多古生 物学家都认为，从整体上看，生物在演化过程中其结构变得更为高级了，表现为一种进化。
已经灭绝的古生物，在胚胎上与近代的同纲动物具有更高的相似性，我的学说可以简单地解释这一奇特的事实。在地层的较晚时期，相同地区中同一类型的演化 过程已经不再是未解之谜了，用生物遗传原理很容易对此进行解释。
假如大家都能认识到地层的记录是不完整的，或者至少可以确定地层无法将全部生物的演化情况完全记录下来，那么对自然选择学说持反对意见的人将会大大减 少，甚至全部消失。
从另一个角度来说，我认为所有古生物学的主要规律都清楚地揭示出， 物种来自于普通的生物繁衍，进化了的新类型将会取代旧类型，而新类型是变异得 到的产物，它们是最适合生存的类型。