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作为一名女法老，哈特谢普苏特女王是独一无二的，但是总体上说，她的魄力仍带有新王国时期，尤其是第十八王朝（公元前1570—公元前1315）的特征。尽管埃及一直在自尼罗河三角洲和阿斯旺以南向东、西两个方向扩张，不过在新王国时期之初，法老们通常会抑制明显的扩张政策。我们不清楚中王国灭亡的原因，但是直到公元前17世纪，下埃及中部的大部分地区仍处在喜克索斯王朝的统治之下，他们很可能是源自迦南人的外来者。喜克索斯王朝的首都是位于三角洲西北的阿瓦里斯，那里的壁画与在克里特岛和锡拉岛上发现的壁画十分相似，表明很可能也有来自克里特岛的侨民在那里生活。
喜克索斯王朝似乎已经吸收了古埃及的传统，而不是将其消除。但是他们依然保留着外来精英的身份，而区别于继续控制自底比斯以下的上埃及的本土统治者。在公元前16世纪60年代，国王卡摩斯（Kamose）准备通过一场河上战役，从喜克索斯人手中夺回阿瓦里斯。他的士兵将战舰作为移动的据点，就像在岸上作战一样，而不是船连着船作战。推翻喜克索斯王朝统治的目的之一，就是把在上埃及与黎凡特贸易中的中间商消灭掉。在对一次胜仗的描述中，卡摩斯吹嘘道：“在几百艘由雪松木制成的新船上，载满了黄金、青金石、银器、绿松石和无数把金属战斧……我将其全部缴获。我没有留下任何一件阿瓦里斯的物品，因为它已经空了，与其亚洲文化一同消失了。”
文中描述了敌人的彻底失败，而在喜克索斯人的最后一位国王被废黜之后，王位归于卡摩斯的继承者雅赫摩斯（Ahmose）。雅赫摩斯是新王国的缔造者，也是第十八王朝的第一位国王。
在洗劫了阿瓦里斯之后，埃及人追击喜克索斯人进入迦南，这意味着他们比其先辈对该地区有了更进一步的经营。近东地区正在经历政治剧变，这缘于米坦尼王国开始从美索不达米亚北部向西扩张。雅赫摩斯和他的历任继承者们一直保持着对该地区的控制。在第17次远征中，图特摩斯三世扩张到叙利亚南部并控制了那里。对该地区的远征与治理，依靠的是古埃及人对比布鲁斯、乌拉扎和阿达塔（今黎巴嫩的黎波里南部）等黎凡特港口的控制。为了准备征服叙利亚的战役，图特摩斯三世储备了大量原材料。巴加尔石碑（Barkal Stela）上的碑文记载道：“现在，国王的每一个港口都能供应上等的面包、各式各样的面包、油、香、葡萄酒、蜂蜜、水果……应有尽有，远远超出陛下的军队的想象。这丝毫也不夸张！”
在第18次远征中，图特摩斯三世率领军队航行到比布鲁斯，那里充足的造船木材对于他之后远征米坦尼有着重要的价值。大多数人并不反对入侵其他国家的战争，直到远征至幼发拉底河。在那里，埃及人在多次战斗中击败了米坦尼人。当米坦尼人从幼发拉底河东面撤退时，图特摩斯三世命令预先准备好的战舰驶入幼发拉底河并向下游进发，毁灭沿途的城镇和村庄，迫使米坦尼人躲进洞穴里。在从海岸拖行船只的过程中，埃及人利用了自己长期从尼罗河运送船只到红海的经验。从尼罗河到红海之间是一段重要而漫长的行程，要穿过大片不宜居住的地形区。
同时，底比斯人也在北部向喜克索斯人发起进攻。他们也开始对抗从努比亚向北扩张的库什王国。自古王国时期以降，埃及的南部边界线一直在第一瀑布和第二瀑布之间来回移动，但是，新王国时期法老对库什王国的征服以其规模之大和持续之久而引人注目。在位于纳帕塔的巴加尔石碑上，记述了图特摩斯三世在叙利亚的功绩。纳帕塔位于距尼罗河下游的第四瀑布20千米处，它作为埃及的南部疆界长达400年之久。埃及当时处于帝国的巅峰时期，从纳帕塔一直延伸到乌加里特（今叙利亚拉斯沙姆拉）。古埃及人与安纳托利亚的赫梯人、亚述人、巴比伦人及美索不达米亚的米坦尼人结盟。在地中海东部，埃及地位的巩固使其与黎凡特的各个港口以及克里特岛之间的贸易往来都进一步加强了。穿着克里特人服饰的商人形象首次出现在一幅墓画中，这是图特摩斯三世的高级执事瑞克赫米尔（Rekhmire）的坟墓。在画中，他们被称为“大海中央的岛民”。
图特摩斯三世的继承者们对黎凡特的兴趣减弱了，但是在第十九王朝时期又有所恢复。然而到公元前13世纪末，大量民众经由陆路和海路向南迁徙，破坏了近东地区青铜时代已确立的秩序，并威胁到了埃及自身的完整性。
古埃及法老统治的诞生及其扩张和发展，依靠的是以尼罗河作为国内交流的一条路径，而大海则是一个过滤器，在抵御外敌入侵时起到缓冲作用，同时也是一个展现政治和军事力量的舞台。古埃及人通过海洋获得了外来的物品，也吸收了外来的影响。经由陆路可以与美索不达米亚交流，但是海上与内河的航行使埃及与该地区的主要王国之间的交流更为便利，这些王国遍布地中海地区以及与其陆地距离不超过100英里的幼发拉底河。古埃及人的军事行动中最引人注目的，就是他们开辟了穿过黎凡特和东地中海地区的海上交通线。在近4,000年的时间里，这条海上交通线一直是海上文化交流和商业贸易的重要中心。