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按照科学史家的观点，免疫学真正成为科学的标志在于，人们终于发现，瘟疫的实质是病原微生物感染人体造成的传染病。也就是说，免疫学作为一门科学，事实上诞生在微生物学的基础之上。
在这之前的免疫学只能算作是对抗疾病的经验性手段。譬如著名的“以毒攻毒”说，就是使用某些毒性较大的药物来对付顽疾；最早的人痘接种，就是用人感染天花后结成的痂来实现对天花的免疫。
19世纪以来，随着微生物学、细胞学、生物化学等等学科的蓬勃发展，人们对免疫学的了解也愈加深入。重要的是，我们依赖各种仪器和装置，获得了观察微观世界的“眼睛”。这里的微观世界，不仅指细胞、细菌、病毒，还包括细胞表面的分子、组成这些分子的蛋白结构以及这些分子所发挥的功能等等。从此，人们找到了更加安全、更加高效地对付疾病的方法。
了解微观世界，是了解现代免疫学的基础。在此，我们将带领大家畅游细胞、分子层面的世界，介绍一些观察微观世界的方法。