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历史科学的另一个方面是根据以上测量数据尽可能恢复出历史原貌（尽管不可能完全恢复），这个结果常被称为关于这个历史对象的“理论”，不过严格说不能算“科学的理论”，因为它只是解释单一历史对象的，依然属于测量基础意义上的数据恢复。
真正科学的理论应当是根据多个恢复的历史原貌，形成具有普遍解释能力的，可以应用于所有历史对象，甚至预测未来发展的、描述一般历史变化的理论。当然，最科学的做法是形成数学化的严格理论。在这个问题上，历史研究的科学性显然远远弱于其测量基础。这种薄弱不仅仅是历史资料的不足，更重要的是历史理论研究方法上的问题。它主要体现在四个方面：
1.历史作用或功过的价值判断。
2.目的与过程的一致性。
3.历史名称对象的高度变化与理论阐述简明性的矛盾。
4.“就史论史”与理论普遍性要求的矛盾。