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《素问·灵兰秘典论》：“心者，君主之官也，神明出焉；肺者，相傅之官，治节出焉；肝者，将军之官，谋虑出焉；胆者，中正之官，决断出焉；膻中者（包括心主即心包络在内），臣使之官，喜乐出焉；脾胃者，仓廪之官，五味出焉；大肠者，传道之官，变化出焉；小肠者，受盛之官，化物出焉；肾者，作强之官，伎巧出焉；三焦者，决渎之官，水道出焉；膀胱者，州都之官，津液藏焉，气化则能出矣。”
人体脏腑的功能，是在既矛盾而又统一的关系中建立的，是相互制约、相互协作的关系，是不可割裂的，必须在统一领导下进行分工协作。这个论点，具体表现在“十二官相使”中。例如将“心”比拟为一个国家的君主，主宰人身的一切，包括神志思维、智慧行动的变化等；将“肺”比作一国宰相，辅佐君主，调治全身功能；将“肝”比作将军，主持谋虑；“胆”好比执法之官，主持决断；“心包”护卫在君主之旁；“脾胃”好比管理国家仓库之官；“大肠”是传道之官，主传递化物糟粕；“小肠”则承受饮食物而发生“转化”；“肾”主持运动与技巧；“三焦”好比疏通河道之官，畅通全身的水道；膀胱主汇集水液，犹如水库一般。这是按“天人合一”的思想学说将人体的脏器功能按社会政体制度，以及某些人事现象作为譬喻，来说明脏腑之各自职责和统一的整体观念。如果一个国家的君主在治理社会方面有失和谐、偏差的话，其他的地方区域也就一错再错，一差再差了。心若失去正常的功能，或“气盛”，或“气虚”，都可使身体其他各部发生疾病。心如果失职，停止跳动，那么后果也就可想而知了。
余认为，任何一件东西都要有一个中心点，一篇文章需要有一个主题思想。做一件事，更要用心准备。一部机器的转动必须有一个主轴，一个完整的家庭肯定要有一个主事的家长，一个国家务必要有一个贤明的君主作领导，在众多文臣武将之拥戴下，各部门齐心协力，荣辱与共，肝胆相照，方能百战百胜，使这个国家富强、民主、昌盛。
从一个人的身体来说，有一个最重要的生理活动中心，这个中心就是《素问·灵兰秘典论》中所讲的“心者，君主之官”。
余在临床实践时，常留神因“心”这个君主之官的阴、阳、气、血偏盛偏衰所形成的各种疾病。在治疗时，试图抓住“心”这个主题，经过治疗，其他各脏腑疾病亦相应得到好的转归。如遇到小便色赤而短少、口舌糜烂的症状，按脉象，往往左寸关数象明显，用黄连导赤散清热利小便，则口糜溲赤得愈；又如遇口舌生疮、心悸健忘、失眠多梦、大便干燥、舌苔黄厚、舌尖赤红之人，多由心阴不足所致，故用天王补心丹以滋阴养血、补心安神，则口舌生疮、大便干燥、心烦失眠渐去而获奇效；见到各种疼痛、疮疡、瘙痒等外科疾病时，便以“诸痛疮痒，皆属于心”立论以施药，常以三黄泻心汤、真人活命饮、黄连解毒汤治疗，取得明显效果。
古云：心寂则痛微，心躁则痛甚，百端之起，皆自心生。阳虚，可致一身内外阳气衰微、阴寒内盛，症见胸痹心痛、咳嗽气喘，用瓜蒌薤白白酒汤则愈；心阳虚形成脾肾不足的命门火衰，症见饮食无味、腰膝冷痛、阳微宫寒、夜尿频多，常以温通心阳之桂心、附子伍用，可收到事半功倍的效果。
心生七情，若心有过激，则大喜、大怒、久忧、久思、大悲、大恐、大惊现诸于外的癫、狂、痫病，亦是屡见不鲜的。常见妇人多思、多忧形成的二阳病，其因皆归于心脾。有些二三十岁的青年女性患经闭者，其脉多是沉弦细涩，多性格好强，多思多忧，性情乖逆，喜食冷物。在生理上，女子以血为主，和冲、任二脉有直接关系。然，心主血，其心气郁结，肝气郁结，缘由多怒，遇事略有不遂其心者，适逢经来，外受风寒二气之侵袭，则气滞血凝而成经闭血结。
曾治一黑龙江女大学生李某，于2011年8月4日来诊。痤疮满面，燥痒难忍，心烦急躁，大便秘结，小便赤涩，月经周期超前十余日，色暗红，质稠、量多，舌边尖红赤，苔略黄，脉来沉数。余诊为心火暴盛，又兼外受风热湿毒引起，故重在清泻心火，宜清热解毒利湿为治，用防风通圣散化裁，加黄连解毒汤，获满意效果。这就是《内经》病机十九条中“诸痛疮痒，皆属于心”的实际体现。
古云“千般疢难，不越三条”，此三条即：内因、外因、不内外因。妇科病虽以血论，但心才是血的生身之母。所以，“七情为病，当责于心”是无疑的。又如，1976年春，好友之妻在去秦镇的路边见一坟墓处有两条花蛇互相缠绕，顿时吓得不知所措，从此两条蛇始终出现在她的心中，惊恐万分，白天晚上喊个不停，时而昏昏蒙蒙，不吃不喝，他医除了打镇静针之外，别无良法可施。数周过去，病情愈来愈重，其姐邀余至其家诊治，余用“惊者平之”之法，用彩笔画了两条蛇，在患者时昏时醒之际烧掉，患者看到蛇被烧死遂逐渐入睡而愈。这是一则明显的“心为神怯惊恐之源”的案例。
2016年7月11日，诊治一例男青年杨某，神志痴呆，默默无言，满脸愁容，食不思，夜不寐，终日坐在房中，自言自语，喜笑若狂，时又默不作声，已半年余。家人代诉患者因大学毕业后参加工作，爱慕一女青年，后因对方嫌其工资低，提出分手，遂渐成此疾，良由心气内郁，久忧伤其心脾，郁怒难化而成。余用养心安神、解郁疏肝之品，如黄芪、党参、炒酸枣仁、朱茯神、珍珠母、龙眼肉、当归、黄连、铁落、磁石、阿胶、麦冬、生地黄、佛手等共26剂，同时予以安慰而得痊愈。此因失恋，久而心气内郁造成之久癫欲狂病，经用以上诸药，又兼“开其心锁”之良言相劝，使其久郁之心气得以化解而愈。
1990年8月16日，诊治山西省河津县樊村镇6组村民任某。因在陕西经商遇事失利，遂患右胁胀痛一年余，诸药无效，经某医院确诊为肝癌，诸医束手无策。问其日饮牛乳一杯，别无他食，骨瘦如柴，势若难支，右胁处不能触及，腹胀痛难忍，便秘溲赤如血，五心烦热，舌紫苔黄厚，脉沉弦细涩。属心气郁结，忧怒之气伤及肝脾，以致食血相结。余思之再三，处六郁汤加大柴胡汤，服药三剂后，自觉有一物由痛处下移至腹部，如厕遂下鸡卵大粉色肉囊一枚，其痛顿觉若失，且有饥饿感，当日遂进稀粥一碗，蒸馍一块，后以小柴胡汤加味调理得愈。
细思此症，缘于西安经商遇挫，心受刺激，郁怒难解而患此肝胃血积食郁之疾。故用六郁汤解心郁，加大柴胡汤荡涤肠胃之积而获奇效。
以上诸多病类之起因，皆由心的阴、阳、气、血失调导致各脏腑为病的案例，是余所著《诸病源心论》的理论根据，也是诸病为何源于心的问题解答。